RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424439.2

NHLRC4-201, Transcript of NHL repeat containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene NHLRC4, Length 2,097 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4-201ENST00000424439 FAPQ12884 760 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLRC4-201ENST00000424439 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NHLRC4-201ENST00000424439 HEPACAMQ14CZ8 416 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLRC4-201ENST00000424439 LCN1P1Q5VSP4 162 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLRC4-201ENST00000424439 FIBINQ8TAL6 211 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLRC4-201ENST00000424439 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NHLRC4-201ENST00000424439 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NHLRC4-201ENST00000424439 TIFAQ96CG3 184 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLRC4-201ENST00000424439 RHCGQ9UBD6 479 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLRC4-201ENST00000424439 ICKQ9UPZ9 632 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLRC4-201ENST00000424439 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 FKTNO75072 461 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 SMIM11AP58511 58 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 DCDC1P59894 354 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 FAM209AQ5JX71 171 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 DCST1Q5T197 706 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 ARMCX6Q7L4S7 300 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 ENKURQ8TC29 256 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 KCTD7Q96MP8 289 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 NELL2Q99435 816 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 SOSTQ9BQB4 213 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 ANKRA2Q9H9E1 313 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 A4GALTQ9NPC4 353 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 HCSTQ9UBK5 93 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 A0A1W2PRB8 838 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 WWP2O00308 870 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 PLD2O14939 933 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 NPC1O15118 1278 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 ABLIM3O94929 683 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 RAB36O95755 333 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 TSPAN19P0C672 248 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 GZMKP49863 264 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 PLK5Q496M5 336 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 LIPKQ5VXJ0 399 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 IKBIPQ70UQ0 350 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 CPXM2Q8N436 756 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 DUSP18Q8NEJ0 188 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 TRIM39Q9HCM9 518 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 DIABLOQ9NR28 239 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 PCM1Q15154 2024 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 SH3BGRLO75368 114 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 OLFM2O95897 454 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 GPC1P35052 558 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 DAB2P98082 770 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 EFR3AQ14156 821 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 GPR19Q15760 415 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 C3orf38Q5JPI3 329 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 LHX8Q68G74 356 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 CD300LDQ6UXZ3 194 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 PKP4Q99569 1192 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 FUZQ9BT04 418 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 DMRT3Q9NQL9 472 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 YIPF1Q9Y548 306 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 A0A1W2PQY0 241 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 ERVH48-1M5A8F1 160 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 ARHGEF9O43307 516 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 KLHL18O94889 574 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 GNRH1P01148 92 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 C1QBP02746 253 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 ALAS2P22557 587 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 IL12RB1P42701 662 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 TGM4P49221 684 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 P2RX3P56373 397 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 PPP3R1P63098 170 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 SEC23BQ15437 767 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 PYDC2Q56P42 97 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 USP30Q70CQ3 517 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 OR52I1Q8NGK6 324 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 EFCAB11Q9BUY7 163 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 ACAD8Q9UKU7 415 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 IRGMA1A4Y4 181 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 HOXA2O43364 376 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 H1F0P07305 194 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 GAAP10253 952 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 ZNF30P17039 623 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 MAP2K3P46734 347 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 CD83Q01151 205 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 MC1RQ01726 317 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 TPBGQ13641 420 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLRC4-201ENST00000424439 MPPE1Q53F39 396 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms