RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 RP1P56715 2156 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO10Q9HD67 2058 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MEIOCA2RUB1 952 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 H0Y626 953 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PLPP1O14494 284 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C8GP07360 202 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOAP61586 193 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 E2F1Q01094 437 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HORMAD2Q8N7B1 307 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AMER3Q8N944 861 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NECTIN4Q96NY8 510 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ELOVL6Q9H5J4 265 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS6KA6Q9UK32 745 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GPSM3Q9Y4H4 160 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN6O43657 245 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAM11O75078 769 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NFATC1O95644 943 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FEN1P39748 380 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPK8P45983 427 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNC3Q14003 757 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CAMK1Q14012 370 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RETSATQ6NUM9 610 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OXR1Q8N573 874 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SIMC1Q8NDZ2 872 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF555Q8NEP9 628 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM175Q9BSA9 504 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MFRPQ9BY79 579 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 WASH6PQ9NQA3 447 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HMX3A6NHT5 357 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM16O95361 564 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FHP07954 510 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-DMAP28067 261 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SOX3P41225 446 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC11A2P49281 568 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF136P52737 540 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IL1RL1Q01638 556 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF438Q7Z4V0 828 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PEX5LQ8IYB4 626 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GIPC2Q8TF65 315 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF681Q96N22 645 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC46A2Q9BY10 475 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RHBGQ9H310 441 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MARCH7Q9H992 704 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVK13-1Q9NX77 482 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MARK1Q9P0L2 795 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL21Q9UJP4 597 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF221Q9UK13 617 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF215Q9Y6U7 377 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR179Q6PRD1 2367 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A087WUU8 490 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SGK494L7N484 410 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SUV39H1O43463 412 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TBXA2RP21731 343 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ETV5P41161 510 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PREPP48147 710 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ETV1P50549 477 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CDH12P55289 794 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KBTBD8Q8NFY9 601 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS4Y2Q8TD47 263 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C10orf90Q96M02 699 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM39AQ9NV64 488 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 WWOXQ9NZC7 414 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CBLCQ9ULV8 474 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.44□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPBD1B2RD01 187 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LANCL1O43813 399 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AP2A2O94973 939 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SYN1P17600 705 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF763Q0D2J5 394 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPA14Q0VDF9 509 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NCF4Q15080 339 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SPHARQ15513 63 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ERAP2Q6P179 960 aa3.43□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF793Q6ZN11 406 aa3.43□□□□□ -1.86
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