RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PACS2Q86VP3 889 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LAS2Q8IYD9 372 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM9CQ8IZT9 166 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACBD4Q8NC06 268 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SELENOMQ8WWX9 145 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NEIL2Q969S2 332 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TEX37Q96LM6 180 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GBP5Q96PP8 586 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SERPINI1Q99574 410 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NPAS2Q99743 824 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LIME1Q9H400 295 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MVB12BQ9H7P6 319 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WDR41Q9HAD4 459 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SIRT5Q9NXA8 310 aa9□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A0G2JNG1 304 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ASPDHA6ND91 283 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIR2DS3K7RE56 304 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MRASO14807 208 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CIB2O75838 187 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 G6PDP11413 515 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 F3P13726 295 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC2A4P14672 509 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAPK1P28482 360 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IL12AP29459 219 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C21orf58P58505 322 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSME3P61289 254 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL38P63173 70 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HMGCS1Q01581 520 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACY1Q03154 408 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRKG2Q13237 762 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIR2DS5Q14953 304 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TLR1Q15399 786 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPR19Q15760 415 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNCBQ16143 134 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IMPG1Q17R60 797 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MMEL1Q495T6 779 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C6orf163Q5TEZ5 329 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRMT9Q6P2P2 845 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM26Q6ZUK4 368 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RETREG3Q86VR2 466 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DPP10Q8N608 796 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPFIBP2Q8ND30 876 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR7G3Q8NG95 312 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC5A11Q8WWX8 675 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NR4A3Q92570 626 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 REPS1Q96D71 796 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPDL1Q96EA4 605 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC41A2Q96JW4 573 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLPTM1LQ96KA5 538 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAAR6Q96RI8 345 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HBEGFQ99075 208 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C1orf50Q9BV19 199 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PELI2Q9HAT8 420 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM181Q9P2C4 612 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ABCD2Q9UBJ2 740 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa8.99□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1W2PPV9 198 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FXYD1O00168 92 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NR5A2O00482 541 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PEX12O00623 359 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANGPT2O15123 496 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRMT3O60678 531 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ENTPD5O75356 428 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SEC22BO75396 215 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 INHBBP09529 407 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BCKDHAP12694 445 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NDUFS1P28331 727 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PIK3CBP42338 1070 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARL4DP49703 201 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms