RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 FTSJ1Q9UET6 329 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 NDOR1Q9UHB4 597 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 DSPPQ9NZW4 1301 aa22.61■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 MUC3AQ02505 3323 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 C5orf58C9J3I9 102 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 RECKO95980 971 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 PIPP12273 146 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 SLC6A11P48066 632 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 IDH2P48735 452 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 LIMK1P53667 647 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 LSM3P62310 102 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CEACAM20Q6UY09 585 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ZNF367Q7RTV3 350 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 EGFL6Q8IUX8 553 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 STX19Q8N4C7 294 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 FAM210AQ96ND0 272 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 OBP2AQ9NY56 170 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 GDE1Q9NZC3 331 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 DAPK2Q9UIK4 370 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 PCDH17O14917 1159 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 LAMP2P13473 410 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CRISP1P54107 249 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 SMIM11AP58511 58 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CNTN1Q12860 1018 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ZNF404Q494X3 552 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 FAM46CQ5VWP2 391 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 FRMPD2BQ6IN97 320 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 AMER2Q8N7J2 671 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 KBTBD8Q8NFY9 601 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 IL17FQ96PD4 163 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 MENTQ9BUN1 341 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 DSN1Q9H410 356 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 MGAT4BQ9UQ53 548 aa22.6■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ISPDA4D126 451 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 TOR1BO14657 336 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 MFN2O95140 757 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 P2RY2P41231 377 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 MANFP55145 182 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CASP9P55211 416 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 NUDT13Q86X67 352 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 MCFD2Q8NI22 146 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 SLC38A5Q8WUX1 472 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 PROX1Q92786 737 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 FGF14Q92915 247 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 RGMAQ96B86 450 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 RACGAP1Q9H0H5 632 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ACSL5Q9ULC5 683 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 METTL15A6NJ78 407 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 SAGE2PA6NJ88 616 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 KMOO15229 486 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 PSMD7P51665 324 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 PDGFRLQ15198 375 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 RAB42Q8N4Z0 105 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD53Q8N9V6 530 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 AQP11Q8NBQ7 271 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 OR9Q2Q8NGE9 314 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 SMARCD2Q92925 531 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 CLN6Q9NWW5 311 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 TAC3Q9UHF0 121 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa22.58■■□□□ 1.21
PMS1-205ENST00000409985 J3KTA2 159 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ADORA3P0DMS8 318 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 IMPDH2P12268 514 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 DRD2P14416 443 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ALDH4A1P30038 563 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 DMPKQ09013 629 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 MESP2Q0VG99 397 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ST3GAL4Q11206 333 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 ILKQ13418 452 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 DUSP7Q16829 419 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 C19orf48Q6RUI8 117 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 KLHL17Q6TDP4 642 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 PARM1Q6UWI2 310 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 BTLAQ7Z6A9 289 aa22.58■■□□□ 1.2
PMS1-205ENST00000409985 TAGAPQ8N103 731 aa22.58■■□□□ 1.2
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