RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 PLCH1Q4KWH8 1693 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NME4O00746 187 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 STATHP02808 62 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MT-ND5P03915 603 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GRIK2Q13002 908 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 ARL6IP1Q15041 203 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MEDAGQ5VYS4 303 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GALNT10Q86SR1 603 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM135Q86UB9 458 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 TICAM1Q8IUC6 712 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 POGLUT1Q8NBL1 392 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 OR13J1Q8NGT2 312 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 NEIL3Q8TAT5 605 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 GRHL3Q8TE85 626 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 SYT4Q9H2B2 425 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRM-202ENST00000400053 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 C6orf47O95873 294 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PLATP00750 562 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 KDELR2P33947 212 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ACTR1BP42025 376 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ETV4P43268 484 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TLE2Q04725 743 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 NPRL3Q12980 569 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GK3PQ14409 553 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 DEFB115Q30KQ5 88 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RAB6CQ53S08 254 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 OR6C4Q8NGE1 309 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 MFSD8Q8NHS3 518 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 POTEKPQ9BYX7 375 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SLC39A1Q9NY26 324 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 LRRN3E7EW58 273 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 FAM72CH0Y354 149 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 WNT9AO14904 365 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PROM1O43490 865 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 OAZ2O95190 189 aa8.52□□□□□ -1.05
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PTPRM-202ENST00000400053 BMP2P12643 396 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 HSD11B2P80365 405 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 FAM72BQ86X60 149 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RNF130Q86XS8 419 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 FTMTQ8N4E7 242 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 OR51G2Q8NGK0 314 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM234Q8WY98 164 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 LRRN3Q9H3W5 708 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SLC19A2O60779 497 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 EBLN1P0CF75 366 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CBSLP0DN79 551 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CBSP35520 551 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 PER3P56645 1201 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 BEND4Q6ZU67 534 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 FRS2Q8WU20 508 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RAD9AQ99638 391 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ACTR6Q9GZN1 396 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 WDR26Q9H7D7 661 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 NLGN3Q9NZ94 848 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 FLRT2O43155 660 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 RP2O75695 350 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 LCKP06239 509 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRM-202ENST00000400053 KCNQ1P51787 676 aa8.52□□□□□ -1.05
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