RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 PPP2R1BP30154 601 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 RPL5P46777 297 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 CCT3P49368 545 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 RPS6KA3P51812 740 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 RACK1P63244 317 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 HHEXQ03014 270 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 GNA13Q14344 377 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 GK3PQ14409 553 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 PRSS53Q2L4Q9 553 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 KCTD21Q4G0X4 260 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 MANEAQ5SRI9 462 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 REEP3Q6NUK4 255 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 SLC48A1Q6P1K1 146 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 FIGLAQ6QHK4 219 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 VN1R4Q7Z5H5 301 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 GKN2Q86XP6 184 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ARL10Q8N8L6 244 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 PJA1Q8NG27 643 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 OR56A1Q8NGH5 318 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 NFKBIDQ8NI38 313 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 RASSF5Q8WWW0 418 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 TM4SF19Q96DZ7 209 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 SERINC2Q96SA4 455 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ORAI3Q9BRQ5 295 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 AICDAQ9GZX7 198 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ABCG4Q9H172 646 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 SLAMF7Q9NQ25 335 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 HRASLS2Q9NWW9 162 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 MS4A12Q9NXJ0 267 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ASB4Q9Y574 426 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 SPACA6W5XKT8 324 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 OR5K3A6NET4 321 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 MYO1GB0I1T2 1018 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 H3BNH8 94 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 B3GALT2O43825 422 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 HS6ST1O60243 411 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 SNAP29O95721 258 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 SMIM18P0DKX4 95 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 IL9P15248 144 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 NME1P15531 152 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 MPIP34949 423 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 KHKP50053 298 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 RAB8AP61006 207 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 TUBA4AP68366 448 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 KCNJ10P78508 379 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 PRR5P85299 388 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 VLDLRP98155 873 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 IL18R1Q13478 541 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 TP53BP2Q13625 1128 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 APOFQ13790 326 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 GAS6Q14393 721 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 C16orf72Q14CZ0 275 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 LIN52Q52LA3 116 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 TBPL2Q6SJ96 375 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 SLC36A4Q6YBV0 504 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 USP51Q70EK9 711 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 RNF44Q7L0R7 432 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 C6orf120Q7Z4R8 191 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 VTCN1Q7Z7D3 282 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ARMC8Q8IUR7 673 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 SPEM1Q8N4L4 309 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 FAM46DQ8NEK8 389 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 TSPAN14Q8NG11 270 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 SPPL2AQ8TCT8 520 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 RLN3Q8WXF3 142 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 SLC35G5Q96KT7 338 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 AMDHD1Q96NU7 426 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 OR2A5Q96R48 311 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 EPYCQ99645 322 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 LRRC61Q9BV99 259 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 GLIPR2Q9H4G4 154 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 RUBCNLQ9H714 662 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 THSD1Q9NS62 852 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 C5AR2Q9P296 337 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 KIF17Q9P2E2 1029 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 P2RX2Q9UBL9 471 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 FBXW2Q9UKT8 454 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 ABCG2Q9UNQ0 655 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 KLHL20Q9Y2M5 609 aa10.54□□□□□ -0.72
CTXN3-202ENST00000395322 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms