RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HIST1H2ADP20671 130 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UQCRC1P31930 480 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC1A6P48664 564 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCR3P51677 355 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDH13P55290 713 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXL2P58012 376 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP6V0D1P61421 351 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BST1Q10588 318 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TECRLQ5HYJ1 363 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEK5Q6P3R8 708 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CD163Q86VB7 1156 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SUN5Q8TC36 379 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EDAQ92838 391 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MR1Q95460 341 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPR78Q96P69 363 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DERL2Q9GZP9 239 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARL15Q9NXU5 204 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A8MT66 165 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 G3V2L1 256 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ITM2AO43736 263 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AP2A2O94973 939 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HPXP02790 462 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRLHRP49683 370 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GSK3AP49840 483 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AGTR2P50052 363 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 INHBCP55103 352 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RBBP7Q16576 425 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WLSQ5T9L3 541 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPARTQ8N0X7 666 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLDN23Q96B33 292 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MED8Q96G25 268 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDXPQ96GD0 296 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BMFQ96LC9 184 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WWOXQ9NZC7 414 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KLQ9UEF7 1012 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ASF1AQ9Y294 204 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.09□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.09□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A0G2JND7 137 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR2A25A4D2G3 310 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A8MZ25 164 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 M0R296 226 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KMOO15229 486 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BIRC5O15392 142 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NUAK1O60285 661 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CRCPO75575 148 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSPAN12O95859 305 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGHV4-34P06331 123 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHRNGP07510 517 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CTSEP14091 401 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VCLP18206 1134 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BCKDHBP21953 392 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM23P36406 574 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GDF5P43026 501 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BDKRB1P46663 353 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GZMKP49863 264 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCT8P50990 548 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLCNKAP51800 687 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC18A1P54219 525 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARPC4P59998 168 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARHGAP8P85298 464 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EFNB1P98172 346 aa6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms