RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 HSDL2Q6YN16 418 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 RNF44Q7L0R7 432 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 DTX3Q8N9I9 347 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 FIBINQ8TAL6 211 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 IFT27Q9BW83 186 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 METTL15A6NJ78 407 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 LATS1O95835 1130 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 HMGN1P05114 100 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 CASP3P42574 277 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 SLC9A3P48764 834 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 ABATP80404 500 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 ADAM15Q13444 863 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 FAM129CQ86XR2 697 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 CSF3RQ99062 836 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 CARNS1A5YM72 827 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 GFRA2O00451 464 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 SSTR4P31391 388 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 ACSL1P33121 698 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 CTNNB1P35222 781 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 PRKCDQ05655 676 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF33BQ06732 778 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 BTBD16Q32M84 506 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 SHFQ7M4L6 423 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 MEIOBQ8N635 442 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 SMPDL3AQ92484 453 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 ACTL8Q9H568 366 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 SIAEQ9HAT2 523 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 TDP1Q9NUW8 608 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 SOBPA7XYQ1 873 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 IFNGP01579 166 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 MPIP34949 423 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 ST3GAL3Q11203 375 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 OR5M11Q96RB7 305 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 BRF2Q9HAW0 419 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 VNN3Q9NY84 501 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 NLKQ9UBE8 527 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 PHF11Q9UIL8 331 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 NDUFB5O43674 189 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 PTPN2P17706 415 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 VRK3Q8IV63 474 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 OR10G6Q8NH81 332 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 MTG2Q9H4K7 406 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
PTPRU-201ENST00000345512 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 A0A1W2PQ09 198 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ACP5P13686 325 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 IDSP22304 550 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 FBXW4P57775 412 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM25Q86YD3 366 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 SNX33Q8WV41 574 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 OR10H2O60403 315 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 SLC3A1Q07837 685 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 NOGQ13253 232 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 OR4C6Q8NH72 309 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 KLK6Q92876 244 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 IRF7Q92985 503 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 SLC22A12Q96S37 553 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ADAP2Q9NPF8 381 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 TTC3P53804 2025 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ARHGAP33O14559 1287 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 RCVRNP35243 200 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 RAB8AP61006 207 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 DSG2Q14126 1118 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.046e-7■■■□□ 14.6
PTPRU-201ENST00000345512 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 WDR48Q8TAF3 677 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.3 ms