RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 TNFRSF17Q02223 184 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CEACAM20Q6UY09 585 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 FAM92BQ6ZTR7 304 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SUN3Q8TAQ9 357 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 Q9H521 79 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 STARD5Q9NSY2 213 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TMEM74BQ9NUR3 256 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 GIMAP4Q9NUV9 329 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 DNAJB9Q9UBS3 223 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 AP4B1Q9Y6B7 739 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 UPK1AO00322 258 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZNF23P17027 643 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 MPIP34949 423 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CRYBA2P53672 197 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 DSTNP60981 165 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 RPS26P62854 115 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CDK6Q00534 326 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SPIDRQ14159 915 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CEBPEQ15744 281 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 DEFB110Q30KQ9 67 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 PMS2CLQ68D20 193 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 PRSS41Q7RTY9 318 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 NFKBIDQ8NI38 313 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 EDAQ92838 391 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TCTN2Q96GX1 697 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 C8orf4Q9NR00 106 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZSCAN32Q9NX65 697 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 MS4A12Q9NXJ0 267 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 LRIT1Q9P2V4 623 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZNF639Q9UID6 485 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 RNF215Q9Y6U7 377 aa18.11■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 RASAL1O95294 804 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ARAFP10398 606 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ALDH4A1P30038 563 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 MAGEA2P43356 314 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 DUSP2Q05923 314 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TP53BP2Q13625 1128 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 C6orf52Q5T4I8 152 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 VTCN1Q7Z7D3 282 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 DNAJC22Q8N4W6 341 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 HORMAD2Q8N7B1 307 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 C10orf90Q96M02 699 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZNF681Q96N22 645 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 LYRM4Q9HD34 91 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SEMA3GQ9NS98 782 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ADPRHL2Q9NX46 363 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SLC22A7Q9Y694 548 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PS29 197 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZNF860A6NHJ4 632 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 EPHA4P54764 986 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 OLR1P78380 273 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 BNC1Q01954 994 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CYBRD1Q53TN4 286 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 FKBP9P1Q75LS8 142 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TMBIM1Q969X1 311 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 HSH2DQ96JZ2 352 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TGM7Q96PF1 710 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 IL1RAPQ9NPH3 570 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa18.1■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 GNGT2O14610 69 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SUV39H1O43463 412 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CTSBP07858 339 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ALPPL2P10696 532 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 PTGER1P34995 402 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 GFERP55789 205 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 NKAIN2Q5VXU1 208 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TMEM64Q6YI46 380 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CCDC80Q76M96 950 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 SZRD1Q7Z422 152 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 C11orf74Q86VG3 221 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 ARL10Q8N8L6 244 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 GAB3Q8WWW8 586 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 NCSTNQ92542 709 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 GATA6Q92908 595 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 TPD52L3Q96J77 140 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 CSF3RQ99062 836 aa18.09■□□□□ 0.49
UPP1-201ENST00000331803 OSBPL11Q9BXB4 747 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms