RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 EFCAB9A8MZ26 197 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CPNE6O95741 557 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 APOA1P02647 267 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CLDN2P57739 230 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 DSTNP60981 165 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CDK3Q00526 305 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RUNX3Q13761 415 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PARM1Q6UWI2 310 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 FAM129CQ86XR2 697 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 C11orf65Q8NCR3 313 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 HERVK_113Q902F9 699 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 FGF14Q92915 247 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 UQCC2Q9BRT2 126 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 REEP4Q9H6H4 257 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 IL1RAPQ9NPH3 570 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CD93Q9NPY3 652 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 EQTNQ9NQ60 294 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 MARK1Q9P0L2 795 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RPS6KA6Q9UK32 745 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CARNS1A5YM72 827 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ALX3O95076 343 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 MT-ND2P03891 347 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 GPC1P35052 558 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RAB8AP61006 207 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SCARB2Q14108 478 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 MPEG1Q2M385 716 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SPATS1Q496A3 300 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SPIN4Q56A73 249 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SDE2Q6IQ49 451 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 HIPK1Q86Z02 1210 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CHTF18Q8WVB6 975 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 LGALS12Q96DT0 336 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 FEVQ99581 238 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PSD2Q9BQI7 771 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 IER2Q9BTL4 223 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 C12orf10Q9HB07 376 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 GPATCH2Q9NW75 528 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 FBXL12Q9NXK8 326 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SMIM30A4D0T7 59 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CENPXA8MT69 81 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 H0Y8X5 98 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 LILRB5O75023 590 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 BCHEP06276 602 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 OPRD1P41143 372 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CASP3P42574 277 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ASMTP46597 345 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 OR2B6P58173 313 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CD83Q01151 205 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SGCGQ13326 291 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SHHQ15465 462 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PNCKQ6P2M8 343 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM145Q8NBT3 493 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 WDR26Q9H7D7 661 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RAD18Q9NS91 495 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ASIC5Q9NY37 505 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 EHD3Q9NZN3 535 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.62□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TNFRSF11BO00300 401 aa9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 DYRK3O43781 588 aa9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SCO2O43819 266 aa9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CST6Q15828 149 aa9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 GAB4Q2WGN9 574 aa9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 KLHL17Q6TDP4 642 aa9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CEACAM20Q6UY09 585 aa9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 USP51Q70EK9 711 aa9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TAGAPQ8N103 731 aa9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SVOPLQ8N434 492 aa9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms