RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 CCT3P49368 545 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 HMGA2P52926 109 aa22.73■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SPCS2Q15005 226 aa22.73■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 DNASE1L2Q92874 299 aa22.73■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 UCN3Q969E3 161 aa22.73■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 BCL7BQ9BQE9 202 aa22.73■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PREBQ9HCU5 417 aa22.73■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 MSRAQ9UJ68 235 aa22.73■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.73■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PCDH17O14917 1159 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SLC31A1O15431 190 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 GABARAPO95166 117 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 CTF1Q16619 201 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 OR2L3Q8NG85 312 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 KLHL31Q9H511 634 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ACOT13Q9NPJ3 140 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ARRDC5A6NEK1 342 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 HOXB2P14652 356 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 COL9A1P20849 921 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 NR4A1P22736 598 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ACVR2AP27037 513 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PSMB9P28065 219 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PPP2CBP62714 309 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PPP2CAP67775 309 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TAGAPQ8N103 731 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 FBXL6Q8N531 539 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D19Q8N5T2 526 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 IL17RCQ8NAC3 791 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PROX1Q92786 737 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SLC35G5Q96KT7 338 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 OR2M4Q96R27 311 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SIGLEC11Q96RL6 698 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 KCND3Q9UK17 655 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa22.72■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PRSS38A1L453 326 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ERI3O43414 337 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 KDM1AO60341 852 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ADAM23O75077 832 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 MFN2O95140 757 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 NTSP30990 170 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 GPC1P35052 558 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SLC9A5Q14940 896 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ADPRMQ3LIE5 342 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SZRD1Q7Z422 152 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 DEPDC4Q8N2C3 294 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 MS4A6EQ96DS6 147 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 AMDHD1Q96NU7 426 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 GLIPR2Q9H4G4 154 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SERHL2Q9H4I8 314 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ENOPH1Q9UHY7 261 aa22.71■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 A0A1W2PQF6 199 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM247A6NEH6 219 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 C4orf51C9J302 202 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 CLPXO76031 633 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 INHBBP09529 407 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 CBLP22681 906 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 AHRP35869 848 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 HYAL2Q12891 473 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 MAPK11Q15759 364 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 MOGQ16653 247 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 PARP8Q8N3A8 854 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 GPR32P1Q8NGA4 272 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 BORCS5Q969J3 196 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 YIPF6Q96EC8 236 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 ALPK1Q96QP1 1244 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 SPHK1Q9NYA1 384 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 RHCGQ9UBD6 479 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 P2RX2Q9UBL9 471 aa22.7■■□□□ 1.23
TRIM54-201ENST00000296098 AXIN1O15169 862 aa22.7■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 CMPK1P30085 196 aa22.7■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 IDH2P48735 452 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 ST13P50502 369 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 RHOXF1Q8NHV9 184 aa22.7■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF607Q96SK3 696 aa22.7■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 MACROD1Q9BQ69 325 aa22.7■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa22.7■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 ANHXE9PGG2 379 aa22.69■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 MAN2B1O00754 1011 aa22.69■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 SLC28A2O43868 658 aa22.69■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 FUT4P22083 530 aa22.69■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
TRIM54-201ENST00000296098 LIM2P55344 173 aa22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms