RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 S100A10P60903 97 aa20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RANBP10Q6VN20 620 aa20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 OR6N2Q8NGY6 317 aa20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.27■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TNFRSF10BO14763 440 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV6A0A075B6T7 132 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 NOTOA8MTQ0 251 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0513O60268 411 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ID2Q02363 134 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ODF4Q2M2E3 257 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 UGT3A2Q3SY77 523 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RASGRP3Q8IV61 690 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM234Q8WY98 164 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 OR8D2Q9GZM6 311 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 G3V2L1 256 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MUSKO15146 869 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GCGRP47871 477 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 UGT8Q16880 541 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM164Q5U3C3 297 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf189Q5VU69 101 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 KDM1BQ8NB78 822 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GPRC5BQ9NZH0 403 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 STSP08842 583 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MLLT10P55197 1068 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 POU4F2Q12837 409 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM35AQ53FP2 167 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF565Q8N9K5 539 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CLDND1Q9NY35 253 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SARDHQ9UL12 918 aa20.26■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RNF13O43567 381 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RBBP9O75884 186 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 AK1P00568 194 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 UGT2B10P36537 528 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 NOVP48745 357 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF33BQ06732 778 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf183Q5T699 404 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SPATC1Q76KD6 591 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 HS3ST5Q8IZT8 346 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 Q8N402 240 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ACTR6Q9GZN1 396 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF700Q9H0M5 742 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A31A6NKX4 558 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEA8P43361 318 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF81P51508 661 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 BTBD16Q32M84 506 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MLIPQ5VWP3 458 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 OR4C15Q8NGM1 316 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 BCL7BQ9BQE9 202 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 FUNDC2Q9BWH2 189 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 RNF38Q9H0F5 515 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ARMC1Q9NVT9 282 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SH3D21A4FU49 640 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SUOXP51687 545 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SLAMF1Q13291 335 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 NXPE4Q6UWF7 544 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 FOXRED2Q8IWF2 684 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 XKR8Q9H6D3 395 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GATMP50440 423 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 OR56A3Q8NH54 315 aa20.25■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SCGB1D2O95969 90 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ADAP00813 363 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CSTAP01040 98 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF806P0C7X5 589 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9A3P48764 834 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CEACAM19Q7Z692 300 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC120Q96HB5 630 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 STUB1Q9UNE7 303 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA3P12429 323 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GABRA3P34903 492 aa20.24■□□□□ 0.83
CCSAP-201ENST00000284617 GPR143P51810 404 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms