RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4-201ENST00000271628 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
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SF3B4-201ENST00000271628 METTL12A8MUP2 240 aa14.51□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 MAGP20916 626 aa14.51□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 CD27P26842 260 aa14.51□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 DCTP40126 519 aa14.51□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 DSTNP60981 165 aa14.51□□□□□ -0.09
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SF3B4-201ENST00000271628 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.5□□□□□ -0.09
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SF3B4-201ENST00000271628 SLC37A2Q8TED4 501 aa14.5□□□□□ -0.09
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SF3B4-201ENST00000271628 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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SF3B4-201ENST00000271628 BBS4Q96RK4 519 aa14.5□□□□□ -0.09
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SF3B4-201ENST00000271628 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.5□□□□□ -0.09
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SF3B4-201ENST00000271628 C3orf18Q9UK00 162 aa14.5□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.5□□□□□ -0.09
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SF3B4-201ENST00000271628 C4orf51C9J302 202 aa14.49□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
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SF3B4-201ENST00000271628 FOSL2P15408 326 aa14.49□□□□□ -0.09
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SF3B4-201ENST00000271628 CRYBA2P53672 197 aa14.49□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 IST1P53990 364 aa14.49□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 HHEXQ03014 270 aa14.49□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.49□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 IQCHQ86VS3 1027 aa14.49□□□□□ -0.09
SF3B4-201ENST00000271628 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.49□□□□□ -0.09
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