RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 IFNA4P05014 189 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 ITGB7P26010 798 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 SSTR4P31391 388 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 SGSHP51688 502 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 DCDC1P59894 354 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 PLIN5Q00G26 463 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 IL10RBQ08334 325 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 GTF2H3Q13889 308 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 MED22Q15528 200 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 FAHD1Q6P587 224 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 ATRAIDQ6UW56 229 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 SLC25A46Q96AG3 418 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 COQ10AQ96MF6 247 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 DPH7Q9BTV6 452 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 SPATA2Q9UM82 520 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 INSL6Q9Y581 213 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 M0R233 179 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 PRAMEF1O95521 474 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 CYP17A1P05093 508 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 CTPS1P17812 591 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 EIF1P41567 113 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 CDH18Q13634 790 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 XKR7Q5GH72 579 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 Q8N402 240 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 ULK4Q96C45 1275 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 KCNJ15Q99712 375 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 APOL5Q9BWW9 433 aa20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 RAB19A4D1S5 217 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 C2orf78A6NCI8 922 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 VIPP01282 170 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 GGT2P36268 569 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 SNAPC1Q16533 368 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 PFKFB4Q16877 469 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 HECTD3Q5T447 861 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 CLDN22Q8N7P3 220 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 TMEM145Q8NBT3 493 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 BVESQ8NE79 360 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 TADA1Q96BN2 335 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 VAPAQ9P0L0 249 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 HCN3Q9P1Z3 774 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 SEC14L4Q9UDX3 406 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 PFDN2Q9UHV9 154 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 YIPF1Q9Y548 306 aa20.91■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 C7orf66A4D0T2 115 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 H3BNC9 293 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 PRAMEF10O60809 474 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 PRAMEF11O60813 436 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 CBX7O95931 251 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 ATP12AP54707 1039 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 PLD1Q13393 1074 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 ASPGQ86U10 573 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 ISCA2Q86U28 154 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 ZNF251Q9BRH9 671 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 PRR14Q9BWN1 585 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 MND1Q9BWT6 205 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 PDFQ9HBH1 243 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 MYO1GB0I1T2 1018 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 STC2O76061 302 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 POU2F1P14859 743 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 TGM4P49221 684 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 TMEM169Q96HH4 297 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 C10orf90Q96M02 699 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 SEMA3CQ99985 751 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa20.9■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.89■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 SGK494L7N484 410 aa20.89■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 HPGDSO60760 199 aa20.89■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 LAG3P18627 525 aa20.89■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 CD276Q5ZPR3 534 aa20.89■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa20.89■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 SOSTQ9BQB4 213 aa20.89■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 TMEM43Q9BTV4 400 aa20.89■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms