RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040877.1

TARBP1-201, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARBP1, Length 5,130 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-201ENST00000040877 SYNGR4O95473 234 aa22.19■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ITGB7P26010 798 aa22.19■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 GSTM2P28161 218 aa22.19■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 KCNJ5P48544 419 aa22.19■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 GRHL2Q6ISB3 625 aa22.19■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 CHST14Q8NCH0 376 aa22.19■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa22.19■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 RHCEP18577 417 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 DCDC1P59894 354 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 MADCAM1Q13477 382 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 EGFL6Q8IUX8 553 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 RARRES3Q9UL19 164 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 RNF6Q9Y252 685 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 PGCP20142 388 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 RBM34P42696 430 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 OR4D2P58180 307 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 CHAF1BQ13112 559 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ADAM15Q13444 863 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ZFAND2BQ8WV99 257 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 FAM3CQ92520 227 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 TMEM203Q969S6 136 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 TMED9Q9BVK6 235 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 CARD8Q9Y2G2 431 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 PON2Q15165 354 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 MEP1AQ16819 746 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ITFG2Q969R8 447 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 TUBA1CQ9BQE3 449 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 MKLN1Q9UL63 735 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 CSNK1DP48730 415 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 KDELC1Q6UW63 502 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 OR8H1Q8NGG4 311 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 SLC22A8Q8TCC7 542 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 RHCGQ9UBD6 479 aa22.18■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 GPR89AB7ZAQ6 455 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 GPR89BP0CG08 455 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 RAB6CQ53S08 254 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 UBE2J2Q8N2K1 259 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 OR52P1PQ8NH57 321 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 BMFQ96LC9 184 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 SYPP08247 313 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 MAGEA6P43360 314 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 FIGLAQ6QHK4 219 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF224Q9NZL3 707 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 EPHA6Q9UF33 1036 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 SNNO75324 88 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 THEGLP0DJG4 465 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 OR1E2P47887 323 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 HHEXQ03014 270 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 OR52B6Q8NGF0 335 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 VILLO15195 856 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 CLPXO76031 633 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 PSKH1P11801 424 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 CDH15P55291 814 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 SLC7A9P82251 487 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 SEC23BQ15437 767 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 TMEM225Q6GV28 225 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 PGBD2Q6P3X8 592 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 RBCK1Q9BYM8 510 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 TIGARQ9NQ88 270 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 CD207Q9UJ71 328 aa22.17■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 EPCAMP16422 314 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 PLP2Q04941 152 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 DPPA4Q7L190 304 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 CEP76Q8TAP6 659 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 KLF15Q9UIH9 416 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 UNC119BA6NIH7 251 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 TAS2R38P59533 333 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 NFE2L1Q14494 772 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 SGCDQ92629 289 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 IL26Q9NPH9 171 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 HTR3EA5X5Y0 456 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 KDM4BO94953 1096 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 RASAL1O95294 804 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 NTHL1P78549 312 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 OR8J1Q8NGP2 316 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 NCDNQ9UBB6 729 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 RAB41Q5JT25 222 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF367Q7RTV3 350 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 RABEPKQ7Z6M1 372 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 MFSD2AQ8NA29 543 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 NSMAFQ92636 917 aa22.16■■□□□ 1.14
TARBP1-201ENST00000040877 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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