RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CRYBA2P53672 197 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SCN1BQ07699 218 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 C2orf80Q0P641 193 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NFATC2Q13469 925 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SYT14Q8NB59 555 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 USP7Q93009 1102 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DUSP26Q9BV47 211 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SLC32A1Q9H598 525 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 OARD1Q9Y530 152 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 A0A0X1KG70 313 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GABRR3A8MPY1 467 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 KLHL18O94889 574 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 KLKB1P03952 638 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SRCP12931 536 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MAPK9P45984 424 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CLCN4P51793 760 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 P2RX3P56373 397 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MC1RQ01726 317 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GAB1Q13480 694 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF79Q15937 498 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 BTBD16Q32M84 506 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ADGRF1Q5T601 910 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 FRG2Q64ET8 278 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 VRK3Q8IV63 474 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ASB15Q8WXK1 588 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SLC7A6Q92536 515 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 WBP2Q969T9 261 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 FRMD6Q96NE9 622 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 FRG2BQ96QU4 278 aa6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 A0A0G2JN53 185 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SLC35F4A4IF30 521 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DRGXA6NNA5 263 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 M0QZQ0 153 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ADAMDEC1O15204 470 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GRM6O15303 877 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 STX11O75558 287 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CCNB2O95067 398 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GASTP01350 101 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CD72P21854 359 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NTSP30990 170 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MAN2A2P49641 1150 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 RORCP51449 518 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 OLR1P78380 273 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SGCGQ13326 291 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SNAPC1Q16533 368 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 FAHD1Q6P587 224 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SHFQ7M4L6 423 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SERPINA11Q86U17 422 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NATD1Q8N6N6 113 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 RELTQ969Z4 430 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MAP6Q96JE9 813 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TM9SF2Q99805 663 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DOHHQ9BU89 302 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 P2RY12Q9H244 342 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MCUBQ9NWR8 336 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.65□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 A0A0G2JMP0 313 aa6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 GADD45GO95257 159 aa6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 PRPS2P11908 318 aa6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 AMD1P17707 334 aa6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SDC2P34741 201 aa6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 IFNGR2P38484 337 aa6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ARF5P84085 180 aa6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 SPHARQ15513 63 aa6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 USP30Q70CQ3 517 aa6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.65□□□□□ -1.35
NEDD9-216ENST00000620854 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.65□□□□□ -1.35
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