RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 ASF1BQ9NVP2 202 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 ABI3Q9P2A4 366 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 LGALS13Q9UHV8 139 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 VPS4AQ9UN37 437 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 ATG4BQ9Y4P1 393 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 ASB4Q9Y574 426 aa23.25■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 TLDC2A0PJX2 215 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 COPEO14579 308 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 PROM1O43490 865 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 LDB3O75112 727 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 GPR143P51810 404 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 NAA20P61599 178 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 LCP2Q13094 533 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 RDH11Q8TC12 318 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 TANKQ92844 425 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 PARD6BQ9BYG5 372 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 SLC29A3Q9BZD2 475 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 AHSPQ9NZD4 102 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 ADAM29Q9UKF5 820 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 CROCCQ5TZA2 2017 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 TMPRSS11DO60235 418 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 F10P00742 488 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 PDYNP01213 254 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 BIKQ13323 160 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 CYP20A1Q6UW02 462 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 SELENOMQ8WWX9 145 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 VMP1Q96GC9 406 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 GSTO2Q9H4Y5 243 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 MKS1Q9NXB0 559 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 RAB21Q9UL25 225 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 NTNG1Q9Y2I2 539 aa23.24■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 PTPN13Q12923 2485 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 MAN1A2O60476 641 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 FAM58BPP0C7Q3 252 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 CLCN2P51788 898 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 PKNOX1P55347 436 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 IFFO1Q0D2I5 559 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 INAQ16352 499 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 SGO1Q5FBB7 561 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 TRABD2AQ86V40 505 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 C4orf33Q8N1A6 199 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 METTL4Q8N3J2 472 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 CDYL2Q8N8U2 506 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 OR14A16Q8NHC5 309 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 MAP10Q9P2G4 905 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa23.23■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 FGF17O60258 216 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 KRT6AP02538 564 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 KRT6BP04259 564 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 IFNA16P05015 189 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 ENO1P06733 434 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 HSD3B1P14060 373 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 HSD3B2P26439 372 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 KRT6CP48668 564 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 DNAJB13P59910 316 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 C18orf63Q68DL7 685 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 PAGE2Q7Z2X7 111 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 MORN4Q8NDC4 146 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 DEFB126Q9BYW3 111 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 CDCP1Q9H5V8 836 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 SLC12A4Q9UP95 1085 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa23.22■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 GABRR3A8MPY1 467 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 MANBAO00462 879 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 ESRRBO95718 433 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 MLF1P58340 268 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 TUBA3CQ13748 450 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 TUBA3EQ6PEY2 450 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 SUN3Q8TAQ9 357 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 NCLNQ969V3 563 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 TMEM109Q9BVC6 243 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 OXSMQ9NWU1 459 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 NMRK1Q9NWW6 199 aa23.21■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PMS1-220ENST00000618056 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa23.2■■□□□ 1.3
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PR48 441 aa23.2■■□□□ 1.3
PMS1-220ENST00000618056 TCP11X1B4DZS4 312 aa23.2■■□□□ 1.3
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