RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		11.03	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	NIN	Q8N4C6	2090 aa		11.02	□□□□□ -0.64
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A088AWK7	358 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	HRK	O00198	91 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	TP73	O15350	636 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	EPOR	P19235	508 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	MAN2A2	P49641	1150 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	FOLH1	Q04609	750 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ASPH	Q12797	758 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	STX4	Q12846	297 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	TGFBI	Q15582	683 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CEBPE	Q15744	281 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	LYPD8	Q6UX82	237 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PDIK1L	Q8N165	341 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT78	Q8N1N4	520 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC35F6	Q8N357	371 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	OR8K3	Q8NH51	312 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF721	Q8TF20	911 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SGCZ	Q96LD1	299 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	EHD1	Q9H4M9	534 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM221A	A4D161	298 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	FGF17	O60258	216 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SUSD5	O60279	629 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR1	O75083	606 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SH3BGRL	O75368	114 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV3-11	P04433	115 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	KLK2	P20151	261 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	GMPR	P36959	345 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	HSPA7	P48741	367 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	WNT3	P56703	355 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	MGAT5	Q09328	741 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	DOC2A	Q14183	400 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	11.01	□□□□□ -0.65	1e-11	■□□□□ 8.7
TTLL3-233	ENST00000602338	OR4D1	Q15615	310 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	OPN5	Q6U736	354 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ARSK	Q6UWY0	536 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	NINJ1	Q92982	152 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR34	Q96EX3	536 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS39	Q96JC1	886 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	MS4A8	Q9BY19	250 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	DERL2	Q9GZP9	239 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PROK2	Q9HC23	129 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	LYRM4	Q9HD34	91 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	WWOX	Q9NZC7	414 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX12	Q9UMY4	172 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SCEL	O95171	688 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	LRAT	O95237	230 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338		P04436	131 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	TNNI3	P19429	210 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	GGT5	P36269	586 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNC1	P48547	511 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	RCN2	Q14257	317 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC10A1	Q14973	349 aa		11	□□□□□ -0.65
TTLL3-233	ENST00000602338	MPEG1	Q2M385	716 aa		11	□□□□□ -0.65

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