RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMD11	O00231	422 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MANBA	O00462	879 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP6C	O00743	305 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	OR7A17	O14581	309 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	GNGT2	O14610	69 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ADAM12	O43184	909 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIAP1	O43715	76 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	DPM1	O60762	260 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	UGT2B11	O75310	529 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TIPRL	O75663	272 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CLDN7	O95471	211 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CXCL14	O95715	111 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MT-CO1	P00395	513 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	IFNA14	P01570	189 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RB1	P06400	928 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPN2	P17706	415 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CTPS1	P17812	591 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	GGT1	P19440	569 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	GABRR2	P28476	465 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HOXA9	P31269	272 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SPINT3	P49223	89 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	AGTR2	P50052	363 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HK3	P52790	923 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	PGGT1B	P53609	377 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	FOXA1	P55317	472 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TLE2	Q04725	743 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	UBE3A	Q05086	875 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RALGDS	Q12967	914 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAF3	Q13114	568 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	IL10RA	Q13651	578 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	NRF1	Q16656	503 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CDKN3	Q16667	212 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	FUT11	Q495W5	492 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR180	Q86V85	440 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	UBE2E3	Q969T4	207 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52E6	Q96RD3	313 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNA7	Q96RP8	456 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	CLMP	Q9H6B4	373 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71

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