RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 TAP2Q03519 686 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 CDC16Q13042 620 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 GPS1Q13098 491 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAM53BQ14153 422 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 HKDC1Q2TB90 917 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 TTLL9Q3SXZ7 439 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 DUPD1Q68J44 220 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF470Q6ECI4 717 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 CASC4Q6P4E1 433 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 EMBQ6PCB8 327 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM205Q6UW68 189 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 CYHR1Q6ZMK1 362 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 LINC00696Q6ZRV3 163 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 NDUFAF7Q7L592 441 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 DENND6AQ8IWF6 608 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 LMNTD2Q8IXW0 634 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 IFT20Q8IY31 132 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 CSNK1A1LQ8N752 337 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 AMER3Q8N944 861 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 PPFIBP2Q8ND30 876 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 MCUQ8NE86 351 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 CATSPER1Q8NEC5 780 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 DNAJB14Q8TBM8 379 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF480Q8WV37 535 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAR1Q8WVX9 515 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 PSMF1Q92530 271 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 KCNJ9Q92806 393 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 CAVIN3Q969G5 261 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 C8orf44Q96CB5 159 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 CABS1Q96KC9 395 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 C5orf34Q96MH7 638 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 SERPINB12Q96P63 405 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR2A5Q96R48 311 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 PKP4Q99569 1192 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 ERP44Q9BS26 406 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRIM51Q9BSJ1 452 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 C14orf105Q9NVL8 296 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 TAC3Q9UHF0 121 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 C3orf18Q9UK00 162 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 DHRS7Q9Y394 339 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 COMMD10Q9Y6G5 202 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 TACC2O95359 2948 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 H0YIG0 161 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 I3L1I5 382 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 TXNDC9O14530 226 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 HAT1O14929 419 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 GPR42O15529 346 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 P2RX6O15547 441 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZBTB14O43829 449 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 BMP10O95393 424 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 KRT14P02533 472 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 SERPINA7P05543 415 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 HEXBP07686 556 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 F7P08709 466 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 ANXA5P08758 320 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 STSP08842 583 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRR35P0CG20 571 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 HOXA5P20719 270 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 CXCR2P25025 360 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 IMPA1P29218 277 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 TNFSF10P50591 281 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 TDGF1P3P51864 188 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 CTBP1Q13363 440 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 PCOLCEQ15113 449 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 INAQ16352 499 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 LONRF1Q17RB8 773 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC8-202ENST00000577426 SYT16Q17RD7 645 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms