RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	ETHE1	O95571	254 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	MAN2A2	P49641	1150 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	FOLH1	Q04609	750 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	MGAT5	Q09328	741 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	STX4	Q12846	297 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC35F6	Q8N357	371 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	OR8K3	Q8NH51	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF721	Q8TF20	911 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SLCO2A1	Q92959	643 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SGCZ	Q96LD1	299 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXC2	Q99958	501 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	EHD1	Q9H4M9	534 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR1	O75083	606 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	PIAS1	O75925	651 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931		P04436	131 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	EPOR	P19235	508 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	TNNI3	P19429	210 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	PIGA	P37287	484 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	HSPA7	P48741	367 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ASPH	Q12797	758 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	DOC2A	Q14183	400 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC10A1	Q14973	349 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	OPN5	Q6U736	354 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ARSK	Q6UWY0	536 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	NINJ1	Q92982	152 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRC39	Q96DD0	335 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR34	Q96EX3	536 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	LDAH	Q9H6V9	325 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	LYRM4	Q9HD34	91 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	WWOX	Q9NZC7	414 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM221A	A4D161	298 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	HRK	O00198	91 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CLGN	O14967	610 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	TP73	O15350	636 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	FGF17	O60258	216 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SH3BGRL	O75368	114 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	KLK2	P20151	261 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	GGT5	P36269	586 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNC1	P48547	511 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SERTAD2	Q14140	314 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	RCN2	Q14257	317 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CEBPE	Q15744	281 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	MPEG1	Q2M385	716 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	PIGG	Q5H8A4	983 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	WLS	Q5T9L3	541 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	LYPD8	Q6UX82	237 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SNX31	Q8N9S9	440 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	KIAA1191	Q96A73	305 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SARAF	Q96BY9	339 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	VPS39	Q96JC1	886 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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