RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545882.5

CNN3-207, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,902 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-207ENST00000545882 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.55□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 A0A075B6Q4 140 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 MPZL2O60487 215 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 POU1F1P28069 291 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 METAP1P53582 386 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 TEAD2Q15562 447 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 SAXO2Q658L1 398 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 REEP3Q6NUK4 255 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 FAM46DQ8NEK8 389 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 SLC38A5Q8WUX1 472 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 COQ10AQ96MF6 247 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ABCG4Q9H172 646 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 SIAEQ9HAT2 523 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 TLR4O00206 839 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 B4GALT2O60909 372 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 FGF18O76093 207 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 CLTBP09497 229 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 SOX6P35712 828 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ERAP2Q6P179 960 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 DTD2Q96FN9 168 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 SLC6A18Q96N87 628 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 IL17FQ96PD4 163 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 NUAK2Q9H093 628 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 OR2AG1Q9H205 316 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 CFL2Q9Y281 166 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 CKAP5Q14008 2032 aa14.54□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 DYRK3O43781 588 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 CSO75390 466 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 MFN2O95140 757 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 BCHEP06276 602 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 CKMT1AP12532 417 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 OSMP13725 252 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 CSF2RAP15509 400 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ACADLP28330 430 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 TNFSF8P32971 234 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 RCVRNP35243 200 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 BMPR1AP36894 532 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 IFITM2Q01629 132 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 RHAGQ02094 409 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ILKQ13418 452 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 NEURL3Q96EH8 262 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 NRTNQ99748 197 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 UCK2Q9BZX2 261 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 C14orf119Q9NWQ9 140 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 TBC1D24Q9ULP9 559 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ASNA1O43681 348 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 SOX14O95416 240 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ADAP00813 363 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 SCG5P05408 212 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 NR4A2P43354 598 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 ALDH9A1P49189 494 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 C12orf73Q69YU5 71 aa14.53□□□□□ -0.08
CNN3-207ENST00000545882 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms