RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP6CO00743 305 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FFAR3O14843 346 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBDO15205 165 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR42O15529 346 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SDC3O75056 442 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SEC22BO75396 215 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR5F1O95221 314 aa5.37□□□□□ -1.55
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HSD3B1P14060 373 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPHA3P29320 983 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RASSF2P50749 326 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGDIBP52566 201 aa5.37□□□□□ -1.55
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GPR18Q14330 331 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GRB7Q14451 532 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SMU1Q2TAY7 513 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HLA-BQ31612 363 aa5.37□□□□□ -1.55
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C14orf28Q4W4Y0 310 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FRG2Q64ET8 278 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CGB2Q6NT52 195 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C11orf88Q6PI97 169 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NAGSQ8N159 534 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ARL14Q8N4G2 192 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NEIL2Q969S2 332 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FRG2BQ96QU4 278 aa5.37□□□□□ -1.55
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAL3ST1Q99999 423 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa5.37□□□□□ -1.55
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EPB41L1Q9H4G0 881 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GAREM1Q9H706 876 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BRF2Q9HAW0 419 aa5.37□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNK13Q9HB14 408 aa5.37□□□□□ -1.55
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRT87PA6NCN2 255 aa5.36□□□□□ -1.55
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FCHO1O14526 889 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR1F1O43749 312 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PEX11AO75192 247 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UBXN7O94888 489 aa5.36□□□□□ -1.55
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EML2O95834 649 aa5.36□□□□□ -1.55
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FASLGP48023 281 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPP38P78345 283 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MXRA7P84157 204 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TGM3Q08188 693 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CBX3Q13185 183 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NR0B2Q15466 257 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LPAL2Q16609 132 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GSTA3Q16772 222 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC5A12Q1EHB4 618 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCIMPQ6UWF3 145 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.36□□□□□ -1.55
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa5.36□□□□□ -1.55
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