RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531967.5

ECHDC1-222, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ECHDC1, Length 2,585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-222	ENST00000531967	SSX4	O60224	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CNTN5	O94779	1100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	SYNGR4	O95473	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ETFA	P13804	333 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	S100A1	P23297	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	DUSP1	P28562	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MEOX1	P50221	254 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRR5	P85299	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	RHAG	Q02094	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	GCKR	Q14397	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MOG	Q16653	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	SBK1	Q52WX2	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	NEPRO	Q6NW34	567 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM107	Q6UX40	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967		Q6ZS46	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	GATS	Q8NAP1	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC38A4	Q969I6	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PREX2	Q70Z35	1606 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	NUP155	O75694	1391 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CST1	P01037	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	AVP	P01185	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	FCER2	P06734	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	FGF5	P12034	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CREB1	P16220	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ETV4	P43268	484 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	SLC6A8	P48029	635 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CASP4	P49662	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PRPS1	P60891	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	RAB14	P61106	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ADAM8	P78325	824 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	GAB1	Q13480	694 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	KEAP1	Q14145	624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	NR1D2	Q14995	579 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	HSDL2	Q6YN16	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	GPR137	Q96N19	417 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	DRC3	Q9H069	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ECHDC1-222	ENST00000531967	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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