RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 MANSC1Q9H8J5 431 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 C1orf109Q9NX04 203 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 TMED5Q9Y3A6 229 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDH7O60245 1069 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 CEACAM4O75871 244 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 CHN1P15882 459 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 ARRB2P32121 409 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 RPL14P50914 215 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 EFNA3P52797 238 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 BST1Q10588 318 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNAB2Q13303 367 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 OR52E8Q6IFG1 317 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 LANCL3Q6ZV70 420 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 GALNT16Q8N428 558 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 APIPQ96GX9 242 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF160Q9HCG1 818 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 NECTIN3Q9NQS3 549 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 C1orf226A1L170 272 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 ITM2AO43736 263 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 GBAP04062 536 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 CCL11P51671 97 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 CPZQ66K79 652 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 PLAG1Q6DJT9 500 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 SHISA5Q8N114 240 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 AGR3Q8TD06 166 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP3R2Q96LZ3 170 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 LRTM1Q9HBL6 345 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 ADAP2Q9NPF8 381 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 MED4Q9NPJ6 270 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 PSME2Q9UL46 239 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 CCL27Q9Y4X3 112 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 MED13Q9UHV7 2174 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PR48 441 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2W5A6NFC9 320 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 AIFM1O95831 613 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 ALPPP05187 535 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 SERPINA7P05543 415 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 BTKQ06187 659 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 HEPACAMQ14CZ8 416 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 NR6A1Q15406 480 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 C18orf63Q68DL7 685 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 HPS6Q86YV9 775 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM52Q8NDY8 209 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 M1APQ8TC57 530 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 DYDC1Q8WWB3 177 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 IMMP1LQ96LU5 166 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 LHPPQ9H008 270 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 TUBB1Q9H4B7 451 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR83Q9NYM4 423 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 VTI1BQ9UEU0 232 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM233B4DJY2 109 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 SLCO1B7G3V0H7 640 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 PIP5K1BO14986 540 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 DYRK3O43781 588 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 SNNO75324 88 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 SEC22BO75396 215 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 LINC00032P0C843 101 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 COX7A2P14406 83 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 DRD2P14416 443 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 ITGA3P26006 1051 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF763Q0D2J5 394 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 CHAF1BQ13112 559 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 MYBPC3Q14896 1274 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 CES4AQ5XG92 561 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 Q6ZSR9 355 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF781Q8N8C0 355 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 SORT1Q99523 831 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC25A23Q9BV35 468 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM55Q9BYV6 548 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 SAGE2PA6NJ88 616 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-212ENST00000508338 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR75O95800 540 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-212ENST00000508338 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-212ENST00000508338 MAPK1P28482 360 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-212ENST00000508338 HK2P52789 917 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-212ENST00000508338 RAE1P78406 368 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-212ENST00000508338 XKR7Q5GH72 579 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-212ENST00000508338 IKBIPQ70UQ0 350 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-212ENST00000508338 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-212ENST00000508338 TM4SF18Q96CE8 201 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-212ENST00000508338 C19orf60Q96EN9 201 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
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