RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491487.1

CIZ1-222, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 2

Gene CIZ1, Length 339 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-222	ENST00000491487	TNFRSF17	Q02223	184 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	IFT88	Q13099	833 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	IGFBP7	Q16270	282 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	GPR180	Q86V85	440 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	REPS1	Q96D71	796 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	CENPH	Q9H3R5	247 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	HEY2	Q9UBP5	337 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	WDR91	A4D1P6	747 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	MYO1D	O94832	1006 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	MLYCD	O95822	493 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	DDAH2	O95865	285 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	CLPS	P04118	112 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	SFTPC	P11686	197 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	HMOX2	P30519	316 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	FOLH1	Q04609	750 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC13A2	Q13183	592 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	CASP8	Q14790	479 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	TLCD1	Q96CP7	247 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	CCDC126	Q96EE4	140 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	C19orf60	Q96EN9	201 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	PGM2	Q96G03	612 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	SMC6	Q96SB8	1091 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	BRF2	Q9HAW0	419 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	MMP25	Q9NPA2	562 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	SNX6	Q9UNH7	406 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487		A8MUI8	341 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC28A2	O43868	658 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	WDPCP	O95876	746 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	TUBB	P07437	444 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	SERPINB4	P48594	390 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	ARFIP1	P53367	373 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	SKP1	P63208	163 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	BTK	Q06187	659 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	TGM3	Q08188	693 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	KLRB1	Q12918	225 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	MFAP5	Q13361	173 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487		Q6ZS92	163 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487		Q6ZSR9	355 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	NUDT13	Q86X67	352 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	M1AP	Q8TC57	530 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	NUDT8	Q8WV74	236 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	LPAR4	Q99677	370 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	EBPL	Q9BY08	206 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	HES7	Q9BYE0	225 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	SERTM1	A2A2V5	107 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	ULK1	O75385	1050 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	CT62	P0C5K7	136 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	CASR	P41180	1078 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	TLE1	Q04724	770 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	KIAA0040	Q15053	153 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	KANK2	Q63ZY3	851 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	BEST3	Q8N1M1	668 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	NCLN	Q969V3	563 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	C3orf30	Q96M34	536 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CIZ1-222	ENST00000491487	AGAP4	Q96P64	663 aa		13.78	□□□□□ -0.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms