RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 GLRA1P23415 457 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ERVK-16P61578 105 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 GPAT3Q53EU6 434 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 DDI2Q5TDH0 399 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 NUP37Q8NFH4 326 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 TCP11Q8WWU5 503 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 DNASE2BQ8WZ79 361 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 SAMD8Q96LT4 415 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 LITAFQ99732 161 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ASCL2Q99929 193 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 NACA2Q9H009 215 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 GAB2Q9UQC2 676 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 INPP4BO15327 924 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 TNFSF12O43508 249 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0513O60268 411 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM16O95361 564 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 TGFAP01135 160 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 BSPRYQ5W0U4 402 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 HPS4Q9NQG7 708 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 GDF3Q9NR23 364 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 NR5A2O00482 541 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 SYNGR4O95473 234 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN1O95832 211 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 GHRP10912 638 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ACADSBP45954 432 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 HTD2P86397 168 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP69Q49AA0 526 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 EPC2Q52LR7 807 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 C3P1Q6ZMU1 363 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 KIF6Q6ZMV9 814 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZRP5 223 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 TEX9Q8N6V9 391 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF519Q8TB69 540 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 PCED1BQ96HM7 432 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 RAB40CQ96S21 281 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 RAB17Q9H0T7 212 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 KCNK13Q9HB14 408 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 NUDCQ9Y266 331 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 PRR23AA6NEV1 266 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 GLTPD2A6NH11 291 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 SHISA7A6NL88 538 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ANHXE9PGG2 379 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 KRT86O43790 486 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 LRP3O75074 770 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 DESP17661 470 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 CCND2P30279 289 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 GPC3P51654 580 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 CCL11P51671 97 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 RBBP4Q09028 425 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 KRT81Q14533 505 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 CMPK2Q5EBM0 449 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf60Q5U649 245 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 USP43Q70EL4 1123 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 LIPHQ8WWY8 451 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 TAAR6Q96RI8 345 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 SIRPDQ9H106 197 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 K7EQD1 137 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 EDIL3O43854 480 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 RALAP11233 206 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 PKLRP30613 574 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 CAMLGP49069 296 aa6.53□□□□□ -1.36
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