RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF385BQ569K4 471 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 FKBP10Q96AY3 582 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 ITCHQ96J02 903 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 OR2A14Q96R47 310 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 MBOAT4Q96T53 435 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 DGCR6LQ9BY27 220 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 SMURF2Q9HAU4 748 aa16.46■□□□□ 0.23
PRRT4-205ENST00000489835 RFXANKO14593 260 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 GNGT2O14610 69 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 SCN2BO60939 215 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 MAGP20916 626 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 IDUAP35475 653 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 ASMTP46597 345 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 RXRGP48443 463 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 IST1P53990 364 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 MAZP56270 477 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 GABARAPL2P60520 117 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 ABATP80404 500 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 PIGFQ07326 219 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 MEP1AQ16819 746 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 TRIM16LQ309B1 348 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 C6orf141Q5SZD1 244 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 CPTPQ5TA50 214 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 FAM86B1Q8N7N1 296 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 C1orf216Q8TAB5 229 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 FBXO30Q8TB52 745 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF347Q96SE7 839 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 DUSP26Q9BV47 211 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 KCNH6Q9H252 994 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 NT5DC2Q9H857 520 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 RMND5AQ9H871 391 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 LHX9Q9NQ69 397 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 ADGRE2Q9UHX3 823 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 SPEGQ15772 3267 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 VPS13AQ96RL7 3174 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 THADAQ6YHU6 1953 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 UGT2B7P16662 529 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 FUT4P22083 530 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 BSGP35613 385 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 PIGAP37287 484 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 PPP1CAP62136 330 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 ZXDAP98168 799 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 HHEXQ03014 270 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 PRSS53Q2L4Q9 553 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF438Q7Z4V0 828 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 UBE3DQ7Z6J8 389 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 SVOPLQ8N434 492 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 OR10A6Q8NH74 314 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 ITPKCQ96DU7 683 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 SH3GL1Q99961 368 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 TBCDQ9BTW9 1192 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 OSBPL10Q9BXB5 764 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 POT1Q9NUX5 634 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 ACTR10Q9NZ32 417 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 SPASTQ9UBP0 616 aa16.45■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 NDUFS4O43181 175 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 NOBOXO60393 691 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 PRMT3O60678 531 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 IL3P08700 152 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 TYRP1P17643 537 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 PTPN6P29350 595 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 FNTBP49356 437 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF846Q147U1 533 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 RUNDC3AQ59EK9 446 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF425Q6IV72 752 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 ENPP6Q6UWR7 440 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF621Q6ZSS3 439 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 BTLAQ7Z6A9 289 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 C10orf111Q8N326 155 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 FAM174AQ8TBP5 190 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 MUL1Q969V5 352 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 TAMM41Q96BW9 452 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 PANX1Q96RD7 426 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 SIRT5Q9NXA8 310 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 AHSPQ9NZD4 102 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 DAPK2Q9UIK4 370 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 BAG5Q9UL15 447 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 A0A0G2JNG1 304 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 LRIT2A6NDA9 550 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 CLDN25C9JDP6 229 aa16.44■□□□□ 0.22
PRRT4-205ENST00000489835 KIR2DS3K7RE56 304 aa16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms