RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SZRD1Q7Z422 152 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NLGN4XQ8N0W4 816 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GDE1Q9NZC3 331 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EGFP01133 1207 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC159P0C7I6 412 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSMCR30P0CW71 290 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITIH1P19827 911 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACADLP28330 430 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGEA2P43356 314 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRYBA2P53672 197 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2orf80Q0P641 193 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPRL3Q12980 569 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2L2Q8NH16 312 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FEVQ99581 238 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPX2P18283 190 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRIM2P49643 509 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HBA1P69905 142 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC35A2P78381 396 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPIBQ01892 262 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTAPQ13126 283 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGNQ15493 299 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBLL1Q75N03 491 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSD4Q8NDX1 1056 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS37AQ8NEZ2 397 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATL1Q8WXF7 558 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNASE1L2Q92874 299 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR26Q9H7D7 661 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDN25C9JDP6 229 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFN2O95140 757 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EML2O95834 649 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD36P16671 472 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POU1F1P28069 291 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AKAP14Q86UN6 197 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DOK4Q8TEW6 326 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C19orf43Q9BQ61 176 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNFRSF11BO00300 401 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDK2AP1O14519 115 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPPPO94811 219 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASGR2P07307 311 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL3P08700 152 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGAMP11215 1152 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKCAP17252 672 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MPEG1Q2M385 716 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC23LQ6PF05 361 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAD18Q9NS91 495 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.78□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 M0QX08 132 aa14.77□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KMOO15229 486 aa14.77□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IDSP22304 550 aa14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms