RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487270.5

RAD51B-210, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 2,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-210ENST00000487270 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.32□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.32□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.32□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.32□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 SLC34A3Q8N130 599 aa6.32□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 CRELD1Q96HD1 420 aa6.32□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 CEP19Q96LK0 163 aa6.32□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.32□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.32□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.32□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.32□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 ZAR1LA6NP61 321 aa6.31□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 LILRB5O75023 590 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 SERPIND1P05546 499 aa6.31□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 PIK3CBP42338 1070 aa6.31□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 DGKGP49619 791 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 MAPK12P53778 367 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 CNTN1Q12860 1018 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 E2F2Q14209 437 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 SEC23BQ15437 767 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 PNCKQ6P2M8 343 aa6.31□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 C12orf40Q86WS4 652 aa6.31□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 UCN3Q969E3 161 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 NUS1Q96E22 293 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.31□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 SP140LQ9H930 580 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.31□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.31□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 TAC3Q9UHF0 121 aa6.31□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 TSPAN11A1L157 253 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.31□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 SEMA7AO75326 666 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 GPX5O75715 221 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 STATHP02808 62 aa6.31□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 PSMB5P28074 263 aa6.31□□□□□ -1.4
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RAD51B-210ENST00000487270 CDC20Q12834 499 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 20
RAD51B-210ENST00000487270 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 IRF3Q14653 427 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 DHCR24Q15392 516 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 SSX1Q16384 188 aa6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RAD51B-210ENST00000487270 DCST1Q5T197 706 aa6.31□□□□□ -1.4
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