RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 OR5H15A6NDH6 313 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 SAGE2PA6NJ88 616 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 A8MUI8 341 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 INAFM1C9JVW0 142 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM227AF5H4B4 570 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 CLDN4O14493 209 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ADAM10O14672 748 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 B3GALT2O43825 422 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 KLK8O60259 260 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 PRAMEF2O60811 474 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 WDPCPO95876 746 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 F10P00742 488 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 MYBL2P10244 700 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 PCNAP12004 261 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 GFAPP14136 432 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 CD46P15529 392 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 EPB42P16452 691 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 MAOAP21397 527 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 CNTFP26441 200 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 SERPINB1P30740 379 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 MSH2P43246 934 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 MAGEA12P43365 314 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 SERPINB9P50453 376 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 PLA2G16P53816 162 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 MTTPP55157 894 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 HSD17B7P56937 341 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 TAS2R50P59544 299 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 PMP22Q01453 160 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 TFF3Q07654 80 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 RUNX2Q13950 521 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 RCN2Q14257 317 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 MEP1AQ16819 746 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 PFKFB4Q16877 469 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM35AQ53FP2 167 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 TECRLQ5HYJ1 363 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ACER2Q5QJU3 275 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 FCRLBQ6BAA4 426 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 GRHL2Q6ISB3 625 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 MED27Q6P2C8 311 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 C3P1Q6ZMU1 363 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 LAS2Q8IYD9 372 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 CYP4X1Q8N118 509 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 LGI4Q8N135 537 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 BEST3Q8N1M1 668 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC5A8Q8N695 610 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 TEX9Q8N6V9 391 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM47BQ8NA70 645 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 OR7G3Q8NG95 312 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 SUN3Q8TAQ9 357 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 DCAKDQ8WVC6 231 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 NINJ1Q92982 152 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 C18orf12Q96KH6 178 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR78Q96P69 363 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 KCNC2Q96PR1 638 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 F2RL3Q96RI0 385 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 SERINC2Q96SA4 455 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 MS4A8Q9BY19 250 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ROGDIQ9GZN7 287 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.453e-9■■■□□ 16.7
CTDSPL-208ENST00000486978 VPS11Q9H270 941 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 PRM3Q9NNZ6 103 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 STMN3Q9NZ72 180 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ABI3Q9P2A4 366 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF180Q9UJW8 692 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 MEMO1Q9Y316 297 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 NKX2-6A6NCS4 301 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 GABRR3A8MPY1 467 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 A8MUA0 341 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 TRIM49D1C9J1S8 452 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 UGDHO60701 494 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC19A2O60779 497 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 SCELO95171 688 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 TGFB1P01137 390 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ABHD2P08910 425 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 RBP1P09455 135 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 COL6A2P12110 1019 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 CERS1P27544 350 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 PIK3CBP42338 1070 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 SSR2P43308 183 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 PIK3CGP48736 1102 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 LIM2P55344 173 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC13A2Q13183 592 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 TUBA3CQ13748 450 aa5.99□□□□□ -1.45
CTDSPL-208ENST00000486978 GTF2H2Q13888 395 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms