RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 PITPNBP48739 271 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 FHITP49789 147 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 HERV-K104P63124 156 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 UBXN1Q04323 297 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 ZNF146Q15072 292 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 UPP1Q16831 310 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 PAQR6Q6TCH4 344 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 REG3GQ6UW15 175 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 ZNF730Q6ZMV8 503 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 ITIH5Q86UX2 942 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 FAM131BQ86XD5 332 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 ZNF440Q8IYI8 595 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 FBXW8Q8N3Y1 598 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 OR52E1Q8NGJ3 308 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 TAAR6Q96RI8 345 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 PINK1Q9BXM7 581 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 WWP1Q9H0M0 922 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 TSPYL1Q9H0U9 437 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 CARD9Q9H257 536 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 DCLRE1BQ9H816 532 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 WDR41Q9HAD4 459 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 ZNF446Q9NWS9 450 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 NDUFA13Q9P0J0 144 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 MAD2L2Q9UI95 211 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 APPL1Q9UKG1 709 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 EXOC7Q9UPT5 735 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 RNF215Q9Y6U7 377 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 ZHX2Q9Y6X8 837 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 SALL1Q9NSC2 1324 aa2.65□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PPR1 153 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 KPNA7A9QM74 516 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 E9PQ18 207 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 SLC28A1O00337 649 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 TFECO14948 347 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 DCXO43602 365 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 FHP07954 510 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 ABHD2P08910 425 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 TPBGLP0DKB5 382 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 VDRP11473 427 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 ANPEPP15144 967 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 CAPN2P17655 700 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 TRIM23P36406 574 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 GSK3BP49841 420 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 CCR4P51679 360 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 GALK2Q01415 458 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 PAX8Q06710 450 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 RBBP4Q09028 425 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 RIGQ13278 110 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 GCKRQ14397 625 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 OR1C1Q15619 314 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 STX1AQ16623 288 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 FUT11Q495W5 492 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 PEX5LQ8IYB4 626 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 SPAG16Q8N0X2 631 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 ABHD12Q8N2K0 398 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 C8orf46Q8TAG6 207 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 SPPL2AQ8TCT8 520 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 GLYATL1Q969I3 302 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 PNPLA2Q96AD5 504 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 ZNF597Q96LX8 424 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 ZNF560Q96MR9 790 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 GUCD1Q96NT3 240 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 AGAP3Q96P47 875 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 RAB40CQ96S21 281 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 S1PR3Q99500 378 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 LGMNQ99538 433 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 DCTN5Q9BTE1 182 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 TRIM15Q9C019 465 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 NAPBQ9H115 298 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 GNB4Q9HAV0 340 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 KCNK13Q9HB14 408 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 UBQLN2Q9UHD9 624 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 MUTYHQ9UIF7 546 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 STYXL1Q9Y6J8 313 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 HCFC1P51610 2035 aa2.64□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 ABCC9O60706 1549 aa2.63□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa2.63□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa2.63□□□□□ -1.99
SENP6-208ENST00000483859 A8MXK9 166 aa2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms