RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482232.1

GTF2I-208, Transcript of general transcription factor IIi, humanhuman

TSL 2

Gene GTF2I, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2I-208ENST00000482232 CACNA1BQ00975 2339 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 MYL7Q01449 175 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 RPA4Q13156 261 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 LY6DQ14210 128 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 MTF1Q14872 753 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 MEP1BQ16820 701 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 GBP6Q6ZN66 633 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 SPATA21Q7Z572 469 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 NLRP14Q86W24 1093 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 MFN1Q8IWA4 741 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 SLC4A11Q8NBS3 891 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 OR7A2PQ8NGA2 310 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 OR6S1Q8NH40 331 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 DLG5Q8TDM6 1919 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 FAM222BQ8WU58 562 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 SEPT1Q8WYJ6 367 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 TAF4BQ92750 862 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 CORO2AQ92828 525 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 INTS14Q96SY0 518 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 TNMDQ9H2S6 317 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 C11orf49Q9H6J7 331 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 LIPT1Q9Y234 373 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF2I-208ENST00000482232 DNAH12Q6ZR08 3092 aa4.59□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 GBF1Q92538 1859 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SPEF2Q9C093 1822 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 KRT87PA6NCN2 255 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ANXA2P2A6NMY6 339 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PI15O43692 258 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 IGHDP01880 384 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PCP11498 1178 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 HSD17B7P56937 341 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 DSCR10P59022 87 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TAB1Q15750 504 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 KIF6Q6ZMV9 814 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PEX5LQ8IYB4 626 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 FAM89BQ8N5H3 189 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 KLHDC1Q8N7A1 406 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PIK3R3Q92569 461 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SPSB1Q96BD6 273 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ATP6V0BQ99437 205 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PRRG4Q9BZD6 226 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SLC5A7Q9GZV3 580 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 MED20Q9H944 212 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 HPF1Q9NWY4 346 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TBC1D7Q9P0N9 293 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SEPT10Q9P0V9 454 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 KLK13Q9UKR3 277 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 MYO9BQ13459 2157 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 CFAP54Q96N23 3096 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 A0A1B0GUL6 1792 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 WDFY4Q6ZS81 3184 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TRANK1O15050 2925 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 MED23Q9ULK4 1368 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SH3TC1Q8TE82 1336 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 A0A1W2PPR1 153 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 HTR3EA5X5Y0 456 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SNX3O60493 162 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 BAG3O95817 575 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 GBAP04062 536 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ATP1B1P05026 303 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PRKACGP22612 351 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 DNA2P51530 1060 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 XGP55808 180 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 UBASH3AP57075 661 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 KRT71Q3SY84 523 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TLK2Q86UE8 772 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 LCA5Q86VQ0 697 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 ATAD1Q8NBU5 361 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PROX1Q92786 737 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 OVOL2Q9BRP0 275 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 SPHK2Q9NRA0 654 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 TXNDC16Q9P2K2 825 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF2I-208ENST00000482232 PHIPQ8WWQ0 1821 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms