RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 AIF1P55008 147 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CBX1P83916 185 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CNTN2Q02246 1040 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CNTN1Q12860 1018 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GAGE5Q13069 117 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GAGE6Q13070 117 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 NFATC2Q13469 925 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSWIM7Q19AV6 140 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MTX3Q5HYI7 312 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PLPP4Q5VZY2 271 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM65Q6PJ69 517 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 Q8N1X5 172 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ELMOD1Q8N336 334 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TEX26Q8N6G2 289 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC37A3Q8NCC5 494 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CD99L2Q8TCZ2 262 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ASB5Q8WWX0 329 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM37Q8WXS4 190 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 OSTF1Q92882 214 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 IGSF21Q96ID5 467 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFAF3Q9BU61 184 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRCC1Q9C099 1032 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 THAP2Q9H0W7 228 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 IL25Q9H293 177 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 POLKQ9UBT6 870 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GSAPA4D1B5 854 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SDHDO14521 159 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V0E1O15342 81 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ECE2O60344 883 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SDC3O75056 442 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ERLIN1O75477 346 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 UFL1O94874 794 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CSF2P04141 144 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 FGF5P12034 268 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 VCPP55072 806 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1D5P58170 312 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBA1BP68363 451 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF5AQ12840 1032 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 DRP2Q13474 957 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 EXT1Q16394 746 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 KCTD8Q6ZWB6 473 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CBWD2Q8IUF1 395 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC22A9Q8IVM8 553 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GPC2Q8N158 579 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PARP8Q8N3A8 854 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC185Q8N715 623 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 NRACQ8N912 160 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF383Q8NA42 475 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MLKLQ8NB16 471 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA5Q8TBA6 731 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SMPDL3AQ92484 453 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SUSD6Q92537 303 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TPD52L3Q96J77 140 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRG7Q96K78 797 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ERGIC2Q96RQ1 377 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT12Q99456 494 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GON7Q9BXV9 100 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GAREM1Q9H706 876 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 S100A14Q9HCY8 104 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MIOXQ9UGB7 285 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PRDM4Q9UKN5 801 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-209ENST00000473406 SH3PXD2BA1X283 911 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-209ENST00000473406 SNURFLB1AK76 121 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-209ENST00000473406 E9PMD0 336 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-209ENST00000473406 SGK494L7N484 410 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-209ENST00000473406 SOCS2O14508 198 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-209ENST00000473406 PRRG1O14668 218 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-209ENST00000473406 B4GALT2O60909 372 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-209ENST00000473406 GLRA3O75311 464 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-209ENST00000473406 SAP30O75446 220 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT33AO76009 404 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-209ENST00000473406 MT-ND1P03886 318 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTR3P61158 418 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-209ENST00000473406 HERV-K104P61576 105 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGGTB-209ENST00000473406 SNTA1Q13424 505 aa5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.9 ms