RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466159.6

SYNE1-217, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNE1, Length 2,610 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-217ENST00000466159 FFAR1O14842 300 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 PDPK1O15530 556 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 SEMA3DO95025 777 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 CCNB2O95067 398 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 GASTP01350 101 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 STATHP02808 62 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 IFNW1P05000 195 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 SERPIND1P05546 499 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 CDK1P06493 297 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 STSP08842 583 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 POU2F2P09086 479 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 GABRB1P18505 474 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 RHCEP18577 417 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 GJA4P35212 333 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 ZNF846Q147U1 533 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 ARHGAP19Q14CB8 494 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 DGUOKQ16854 277 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 AGBL4Q5VU57 503 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 ADCK1Q86TW2 530 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 AQP11Q8NBQ7 271 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 OR5P2Q8WZ92 322 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 NEURL3Q96EH8 262 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 VMP1Q96GC9 406 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 TMEM19Q96HH6 336 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 BTBD2Q9BX70 525 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 XKR8Q9H6D3 395 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 PELI2Q9HAT8 420 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 EFCAB9A8MZ26 197 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 C5orf58C9J3I9 102 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 SH3BP5O60239 455 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 SEMA7AO75326 666 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 RPN2P04844 631 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 SLC35G4P0C7Q5 338 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 ACP5P13686 325 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 CBLP22681 906 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 FCARP24071 287 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 CXCR2P25025 360 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 REEP5Q00765 189 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 HEPACAMQ14CZ8 416 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 PDGFRLQ15198 375 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 MAPK11Q15759 364 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 RGS21Q2M5E4 152 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 MLIPQ5VWP3 458 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.5□□□□□ -1.05
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SYNE1-217ENST00000466159 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 ADCK2Q7Z695 626 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 GPR32P1Q8NGA4 272 aa8.5□□□□□ -1.05
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SYNE1-217ENST00000466159 SMPDL3AQ92484 453 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 MYDGFQ969H8 173 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 SLC38A4Q969I6 547 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 CHFRQ96EP1 664 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 HMG20AQ9NP66 347 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 COL4A3Q01955 1670 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.5□□□□□ -1.05
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SYNE1-217ENST00000466159 CLDN24A6NM45 220 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 HMGN4O00479 90 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 NDUFS4O43181 175 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 CBFA2T3O75081 653 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 MFN2O95140 757 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 KAT7O95251 611 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 CA3P07451 260 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 BMP4P12644 408 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 CTSKP43235 329 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 CRISP3P54108 245 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 ST3GAL4Q11206 333 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 GPM6BQ13491 265 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 TP53BP2Q13625 1128 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 FGL2Q14314 439 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 TIGD6Q17RP2 521 aa8.5□□□□□ -1.05
SYNE1-217ENST00000466159 LEXMQ3ZCV2 418 aa8.5□□□□□ -1.05
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