RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465122.5

PDCD6IP-208, Transcript of programmed cell death 6 interacting protein, human

TSL 3

Gene PDCD6IP, Length 894 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CASP9	P55211	416 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	STARD6	P59095	220 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	BPIFB3	P59826	476 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SGCG	Q13326	291 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	3.09	□□□□□ -1.91	3e-6	■■■■■ 34.6
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PTPN14	Q15678	1187 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FGD3	Q5JSP0	725 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SEPT8	Q92599	483 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ULK4	Q96C45	1275 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NXPE2	Q96DL1	559 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RUFY1	Q96T51	708 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ABCG8	Q9H221	673 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TNMD	Q9H2S6	317 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GNB4	Q9HAV0	340 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	HACD3	Q9P035	362 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SATB2	Q9UPW6	733 aa		3.09	□□□□□ -1.91
PDCD6IP-208	ENST00000465122		A0A087WZ39	114 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZNF732	B4DXR9	585 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CHUK	O15111	745 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MLNR	O43193	412 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SEC22B	O75396	215 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SAP30	O75446	220 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PRDM1	O75626	825 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GAS8	O95995	478 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	UGT1A6	P19224	532 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CLCN4	P51793	760 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GALK2	Q01415	458 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CDH18	Q13634	790 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PDE7A	Q13946	482 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GRB14	Q14449	540 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DUSP5	Q16690	384 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	VIT	Q6UXI7	678 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MACC1	Q6ZN28	852 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TEX26	Q8N6G2	289 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RNF149	Q8NC42	400 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	URGCP	Q8TCY9	931 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ITFG2	Q969R8	447 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DTD2	Q96FN9	168 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZNF560	Q96MR9	790 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SPATA13	Q96N96	652 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FAM210A	Q96ND0	272 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	POLK	Q9UBT6	870 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		3.08	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SRRM5	B3KS81	715 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TLR4	O00206	839 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PSMD3	O43242	534 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	STBD1	O95210	358 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CXCL14	O95715	111 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NUDT17	P0C025	328 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FOLR2	P14207	255 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FER	P16591	822 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GAP43	P17677	238 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	AADAC	P22760	399 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	IL4R	P24394	825 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GJB2	P29033	226 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PDHA2	P29803	388 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLC1A3	P43003	542 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TNFSF10	P50591	281 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	HLCS	P50747	726 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CSNK2B	P67870	215 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GPR50	Q13585	617 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CEACAM7	Q14002	265 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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