RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 CUL3Q13618 768 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 HORMAD2Q8N7B1 307 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 C5orf34Q96MH7 638 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 PPT2Q9UMR5 302 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 ATG4BQ9Y4P1 393 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 A0A1B0GTL3 188 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 WIPF3A6NGB9 483 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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HOXB3-202ENST00000460160 CYB561P49447 251 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 SERTAD2Q14140 314 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 GPR180Q86V85 440 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 OR14A16Q8NHC5 309 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 MS4A12Q9NXJ0 267 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM216Q9P0N5 145 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 GTF3C1Q12789 2109 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 NOTCH2Q04721 2471 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 A0A0A6YYD5 115 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 FCHO1O14526 889 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 FGF17O60258 216 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 SLC25A12O75746 678 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 SP1P08047 785 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 HLCSP50747 726 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 KCNK10P57789 538 aa22.05■■□□□ 1.12
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HOXB3-202ENST00000460160 C18orf63Q68DL7 685 aa22.05■■□□□ 1.12
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HOXB3-202ENST00000460160 SLC25A25Q6KCM7 469 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM178AQ8NBL3 297 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 PHF11Q9UIL8 331 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 CELSR2Q9HCU4 2923 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 ASPDHA6ND91 283 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM200CA6NKL6 621 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 PPP6CO00743 305 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 TMPRSS11DO60235 418 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 WISP2O76076 250 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 GGTA1PQ4G0N0 100 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 C4orf17Q53FE4 359 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 FRG2Q64ET8 278 aa22.04■■□□□ 1.12
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HOXB3-202ENST00000460160 MORN4Q8NDC4 146 aa22.04■■□□□ 1.12
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HOXB3-202ENST00000460160 C17orf105B2RV13 164 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 PROM1O43490 865 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 NME2P1O60361 137 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 ITGA10O75578 1167 aa22.03■■□□□ 1.12
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HOXB3-202ENST00000460160 NME2P22392 152 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 CDH13P55290 713 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 TEX35Q5T0J7 233 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 GFRALQ6UXV0 394 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 LCA5Q86VQ0 697 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF321PQ8N8H1 164 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 SERPINI1Q99574 410 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 OR8D2Q9GZM6 311 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 GOLGA8RI6L899 631 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 SEMA3DO95025 777 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 STSP08842 583 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 TSPAN8P19075 237 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 HERVK_113P63132 956 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 MAPKAPK3Q16644 382 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 LETMD1Q6P1Q0 360 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 MILR1Q7Z6M3 343 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 SLC2A12Q8TD20 617 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 TANKQ92844 425 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 FRMD6Q96NE9 622 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 ERVK-6Q9BXR3 956 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 SEC14L3Q9UDX4 400 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 TBK1Q9UHD2 729 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 EML6Q6ZMW3 1958 aa22.02■■□□□ 1.11
HOXB3-202ENST00000460160 CROCCQ5TZA2 2017 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-202ENST00000460160 LRRTM2O43300 516 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-202ENST00000460160 UNC5CO95185 931 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-202ENST00000460160 OTCP00480 354 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-202ENST00000460160 TNNI3P19429 210 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-202ENST00000460160 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
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