RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454741.5

TTC28-AS1-219, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,064 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PHF19Q5T6S3 580 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NUP43Q8NFH3 380 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PHOX2BQ99453 314 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MYNNQ9NPC7 610 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GABRQQ9UN88 632 aa14.65□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SLC22A31A6NKX4 558 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 STC2O76061 302 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ETV3P41162 512 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CRISP1P54107 249 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TIGD4Q8IY51 512 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SCAMP4Q969E2 229 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RFT1Q96AA3 541 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RHOP08100 348 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PET100P0DJ07 73 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HLA-EP13747 358 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CD83Q01151 205 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 XKR5Q6UX68 686 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LRRC15Q8TF66 581 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ATP6V1G1O75348 118 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CSN2P05814 226 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SLC36A3Q495N2 470 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TESCQ96BS2 214 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 UNC119BA6NIH7 251 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SNAP29O95721 258 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HERV-K104P61576 105 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DOC2AQ14183 400 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LRRTM2O43300 516 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CSTAP01040 98 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CELP19835 753 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LCN1P31025 176 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PIGGQ5H8A4 983 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NEIL3Q8TAT5 605 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SHISA4Q96DD7 197 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HSPA12BQ96MM6 686 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SH3D21A4FU49 640 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OR12D1P0DN82 309 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 IST1P53990 364 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NPRL3Q12980 569 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CEACAM7Q14002 265 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CMPK2Q5EBM0 449 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CES4AQ5XG92 561 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GPAT4Q86UL3 456 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GLS2Q9UI32 602 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RNF13O43567 381 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DPP6P42658 865 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ACTA2P62736 377 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ACTG2P63267 376 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PMS2P3Q13401 168 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KANK2Q63ZY3 851 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SH2B3Q9UQQ2 575 aa14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GPR32O75388 356 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms