RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450625.1

SH3BP5-207, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 763 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-207ENST00000450625 WDR34Q96EX3 536 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 SCYL1Q96KG9 808 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 KRT12Q99456 494 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 FAM173AQ9BQD7 235 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 LYRM4Q9HD34 91 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 SAYSD1Q9NPB0 183 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 PNPLA3Q9NST1 481 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 COPS7AQ9UBW8 275 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 FOXO6A8MYZ6 492 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 TOXO94900 526 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 P04436 131 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 CPN2P22792 545 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 MAGEA5P43359 124 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 AP5B1Q2VPB7 878 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF793Q6ZN11 406 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 UBE3DQ7Z6J8 389 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ACOT4Q8N9L9 421 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 PDPRQ8NCN5 879 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 BBOF1Q8ND07 529 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 OR8K3Q8NH51 312 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 SMC6Q96SB8 1091 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 RBBP8Q99708 897 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 CPNE1Q99829 537 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 MS4A8Q9BY19 250 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 CD244Q9BZW8 370 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 LDAHQ9H6V9 325 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 IL1RL2Q9HB29 575 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 SACM1LQ9NTJ5 587 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 LIPGQ9Y5X9 500 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 SAP18O00422 153 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ATP6AP2O75787 350 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 GLSO94925 669 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ETHE1O95571 254 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 TGFB1P01137 390 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 COX7A2P14406 83 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 IGFBP2P18065 325 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 EPORP19235 508 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ACVR2AP27037 513 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 MSX1P28360 303 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 SSR2P43308 183 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 DNASE1L1P49184 302 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 TFF3Q07654 80 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 CALCOCO2Q13137 446 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 OPN5Q6U736 354 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 CHSY3Q70JA7 882 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 OR4N5Q8IXE1 308 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 FAM109AQ8N4B1 249 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 TMEM251Q8N6I4 163 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 GOLM1Q8NBJ4 401 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 UBE2E3Q969T4 207 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 SGCZQ96LD1 299 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 GPR22Q99680 433 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF559Q9BR84 538 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 PHACTR1Q9C0D0 580 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 DPH5Q9H2P9 285 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ALG9Q9H6U8 611 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ACAD8Q9UKU7 415 aa15.36■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 OR14I1A6ND48 311 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 FIGNL2A6NMB9 653 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 BCKDKO14874 412 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 CCL3P10147 92 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 CASQ1P31415 396 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 GMPRP36959 345 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 GP5P40197 560 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 RAB10P61026 200 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ETF1P62495 437 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ASPHQ12797 758 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 SLC10A1Q14973 349 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 TESK1Q15569 626 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 TBCCQ15814 346 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 TMEM35AQ53FP2 167 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 MED27Q6P2C8 311 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 RAPH1Q70E73 1250 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 TRILQ7L0X0 811 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 TMEM200AQ86VY9 491 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 CTAGE3PQ8IX95 158 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF721Q8TF20 911 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 UBXN10Q96LJ8 280 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 DGAT2Q96PD7 388 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 EXO5Q9H790 373 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 ALKBH4Q9NXW9 302 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SH3BP5-207ENST00000450625 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms