RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 NOBOXO60393 691 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 C1QL1O75973 258 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 KLHL18O94889 574 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 FKBP9O95302 570 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 BMP10O95393 424 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 SEMG1P04279 462 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 FABP3P05413 133 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 TFAP2AP05549 437 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 IL3P08700 152 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 MAOBP27338 520 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 CMPK1P30085 196 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 AKT2P31751 481 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 HBA1P69905 142 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 PPP2R2BQ00005 443 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 TGM3Q08188 693 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 CLCA4Q14CN2 919 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ZIC1Q15915 447 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 NKG7Q16617 165 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 OR2T5Q6IEZ7 315 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 FAM86B1Q8N7N1 296 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 LINC01555Q8NAE3 123 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF555Q8NEP9 628 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 OR2T29Q8NH02 315 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 CYGBQ8WWM9 190 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 LZICQ8WZA0 190 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 KLK6Q92876 244 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 TM4SF18Q96CE8 201 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ERLEC1Q96DZ1 483 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 PRAP1Q96NZ9 151 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 TSC22D3Q99576 134 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 SLC35A5Q9BS91 424 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ACAT2Q9BWD1 397 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 NLNQ9BYT8 704 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 MOSPD1Q9UJG1 213 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ERVK-11Q9UQG0 969 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 KCNK6Q9Y257 313 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 V9GYQ6 96 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 CKAP5Q14008 2032 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 SAP18O00422 153 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 SLC31A1O15431 190 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 NDUFS4O43181 175 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 LATO43561 262 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 SH3BGRLO75368 114 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 E2F6O75461 281 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 TNFRSF21O75509 655 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF682O95780 498 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 C6orf47O95873 294 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 IGLV3-19P01714 112 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 MT-ND1P03886 318 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ITGA2P17301 1181 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 FPR1P21462 350 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 TTKP33981 857 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 DCTP40126 519 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 PRIM2P49643 509 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 TPMTP51580 245 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 CCR5P51681 352 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 MVDP53602 400 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 SELENOWP63302 87 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 INAVAQ3KP66 663 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF385BQ569K4 471 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 NAGSQ8N159 534 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 C10orf111Q8N326 155 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 METTL25Q8N6Q8 603 aa9.53□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms