RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417985.1

ACTBP1-201, Transcript of actin, beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP1, Length 1,113 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP1-201ENST00000417985 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 C17orf105B2RV13 164 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 LDB3O75112 727 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 WDR47O94967 919 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ATE1O95260 518 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 IGKV3-11P04433 115 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 GABRA1P14867 456 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 CD22P20273 847 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 DNASE1P24855 282 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 GSTM2P28161 218 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 HNMTP50135 292 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 MTTPP55157 894 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ASPHQ12797 758 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ZNF460Q14592 562 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 FLYWCH1Q4VC44 716 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 OPN5Q6U736 354 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ZNF793Q6ZN11 406 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 C9orf40Q8IXQ3 194 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ULK2Q8IYT8 1036 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 WFDC11Q8NEX6 87 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 PAQR8Q8TEZ7 354 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 FAM222BQ8WU58 562 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 SMR3AQ99954 134 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ACKR4Q9NPB9 350 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 B4GALT7Q9UBV7 327 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 OARD1Q9Y530 152 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 PSAT1Q9Y617 370 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 NCKAP5O14513 1909 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 HRKO00198 91 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 TAPBPO15533 448 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 P04436 131 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 DRD2P14416 443 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 EPORP19235 508 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 IVDP26440 423 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 UQCRC1P31930 480 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 PEX19P40855 299 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 WNT3P56703 355 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 TAS2R39P59534 338 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ID2Q02363 134 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 LTBQ06643 244 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 TSNQ15631 228 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 STEAP4Q687X5 459 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 TRIM40Q6P9F5 258 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 CAMKMTQ7Z624 323 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 TNIP2Q8NFZ5 429 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 OR5L2Q8NGL0 311 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 NEIL3Q8TAT5 605 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 NUBPLQ8TB37 319 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 CCT6BQ92526 530 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 WDR34Q96EX3 536 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 F2RL3Q96RI0 385 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 TMEM79Q9BSE2 394 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 NAT9Q9BTE0 207 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 MCMBPQ9BTE3 642 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 SLC6A15Q9H2J7 730 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 EHD1Q9H4M9 534 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 LDAHQ9H6V9 325 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 LYRM4Q9HD34 91 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ZFP64Q9NPA5 681 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ALKBH4Q9NXW9 302 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 GPRC5BQ9NZH0 403 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 A0A088AWK7 358 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 HSPB2A8KAH6 182 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 SCELO95171 688 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 EPPINO95925 133 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 BMP5P22003 454 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 HOXC12P31275 282 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 GGT5P36269 586 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 FNTAP49354 379 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ASCL1P50553 236 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ZNF136P52737 540 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 STX4Q12846 297 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 SERTAD2Q14140 314 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 E2F2Q14209 437 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 HSPB2Q16082 182 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 DEFB113Q30KQ7 82 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 SLC22A10Q63ZE4 541 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms