RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 GADD45GO95257 159 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 RPN2P04844 631 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 GPR89BP0CG08 455 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 ADORA3P0DMS8 318 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 SOAT1P35610 550 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 TGFBR1P36897 503 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 SERPINB10P48595 397 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 CD97P48960 835 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 BCAP31P51572 246 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 MAPK12P53778 367 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 ENPP2Q13822 863 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 WSCD2Q2TBF2 565 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 AGBL4Q5VU57 503 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM236Q5W0B7 351 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 DSG4Q86SJ6 1040 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 F2RL3Q96RI0 385 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 SERHL2Q9H4I8 314 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 DYRK4Q9NR20 520 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 SLC6A14Q9UN76 642 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 A3GALT2U3KPV4 340 aa13.11□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 ANKDD1BA6NHY2 528 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 EFCAB9A8MZ26 197 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 TOR1BO14657 336 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 PDPK1O15530 556 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 IFNW1P05000 195 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 ADRA2AP08913 450 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 PSMD7P51665 324 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 CCR8P51685 355 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 LSM3P62310 102 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 TUBA1BP68363 451 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 TUBA1AQ71U36 451 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 PAGE2Q7Z2X7 111 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 COL21A1Q96P44 957 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 GIN1Q9NXP7 522 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 REV1Q9UBZ9 1251 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 A0A0A6YYD5 115 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 SH3D21A4FU49 640 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 RTCAO00442 366 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 HMGN4O00479 90 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 TMPRSS11DO60235 418 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 GASTP01350 101 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 DDX5P17844 614 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 PSMB5P28074 263 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 GRK5P34947 590 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 ITGADQ13349 1161 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 HEPACAMQ14CZ8 416 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 FBXO43Q4G163 708 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 MINDY2Q8NBR6 621 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 CREB3L4Q8TEY5 395 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 SMPDL3AQ92484 453 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM19Q96HH6 336 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 CDCA4Q9BXL8 241 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 GPR83Q9NYM4 423 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 RAB23Q9ULC3 237 aa13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 REV3LO60673 3130 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 PIPP12273 146 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 CHMP24386 653 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 ATP1A4Q13733 1029 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 TIGD6Q17RP2 521 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 COLEC12Q5KU26 742 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 FAM180BQ6P0A1 224 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF675Q8TD23 568 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 ACAT2Q9BWD1 397 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 SH3GLB1Q9Y371 365 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 METTL15A6NJ78 407 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 NDUFS4O43181 175 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 ADAP00813 363 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 PCCBP05166 539 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 TGM1P22735 817 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 TRIM23P36406 574 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 GSSP48637 474 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 GANABQ14697 944 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 PDGFRLQ15198 375 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 NUDT13Q86X67 352 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 AQP11Q8NBQ7 271 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 SLC25A19Q9HC21 320 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 KMOO15229 486 aa13.09□□□□□ -0.31
ATG4C-201ENST00000317868 MPZL2O60487 215 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms