RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 DKK3Q9UBP4 350 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 KCNK2O95069 426 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 KRT75O95678 551 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 CEBPBP17676 345 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 ST8SIA6P61647 398 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 IRF3Q14653 427 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 OR4D11Q8NGI4 311 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM19Q96HH6 336 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 C5orf58C9J3I9 102 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 CTDSP2O14595 271 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 PPM1DO15297 605 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 CISD3P0C7P0 127 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 VIPR2P41587 438 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 SPATC1Q76KD6 591 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 AMER3Q8N944 861 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 ANKRD53Q8N9V6 530 aa24.12■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 ARHGAP33O14559 1287 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 CYP17A1P05093 508 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 RHCEP18577 417 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 ACADLP28330 430 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 SOX3P41225 446 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 REEP3Q6NUK4 255 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 LACC1Q8IV20 430 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 MINDY2Q8NBR6 621 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 TOX2Q96NM4 488 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 TBC1D14Q9P2M4 693 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 DNAH14Q0VDD8 3507 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 SSX4O60224 188 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 IFNA14P01570 189 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 CLTBP09497 229 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 UQCRC2P22695 453 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 C11orf96Q7Z7L8 435 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 RAD9AQ99638 391 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 ZAR1LA6NP61 321 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 AGRPO00253 132 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 WWP2O00308 870 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 PAPLNO95428 1278 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 S100A5P33763 92 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 MAPK12P53778 367 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 SELENBP1Q13228 472 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 SSX1Q16384 188 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 SPDYE7PQ495Y7 208 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 BCL7AQ4VC05 210 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 NRSN1Q8IZ57 195 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 IQCF1Q8N6M8 205 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 ABHD8Q96I13 439 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 CNPPD1Q9BV87 410 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 CTPS2Q9NRF8 586 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 C14orf119Q9NWQ9 140 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 H3BN98 237 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 H7BY64 318 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 SERPIND1P05546 499 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 RSPRY1Q96DX4 576 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 PRAP1Q96NZ9 151 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 CLN6Q9NWW5 311 aa24.1■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 OR10H3O60404 316 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 GPX5O75715 221 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 PIK3CBP42338 1070 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 TGM4P49221 684 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 HMGA2P52926 109 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 UGT2B15P54855 530 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 PAQR6Q6TCH4 344 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 COMTD1Q86VU5 262 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 FAM20CQ8IXL6 584 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 KBTBD8Q8NFY9 601 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 TM4SF18Q96CE8 201 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 OR5D16Q8NGK9 328 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 MACROD1Q9BQ69 325 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 ERVK13-1Q9NX77 482 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 POU2F3Q9UKI9 436 aa24.09■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 CYP7B1O75881 506 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 ADH5P11766 374 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 DESI1Q6ICB0 168 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 C6orf120Q7Z4R8 191 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 FAM129CQ86XR2 697 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 ANKMY1Q9P2S6 941 aa24.08■■□□□ 1.45
HOXB3-201ENST00000311626 PI15O43692 258 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXB3-201ENST00000311626 ALPPL2P10696 532 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXB3-201ENST00000311626 TCTN3Q6NUS6 607 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXB3-201ENST00000311626 PDXPQ96GD0 296 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXB3-201ENST00000311626 OR52A5Q9H2C5 316 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXB3-201ENST00000311626 RERGLQ9H628 205 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXB3-201ENST00000311626 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms