RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 ITGB7P26010 798 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 MASP1P48740 699 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 DCDC1P59894 354 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SPIBQ01892 262 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF763Q0D2J5 394 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RGNQ15493 299 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PRSS53Q2L4Q9 553 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 LRIF1Q5T3J3 769 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 FLCNQ8NFG4 579 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 OR56A3Q8NH54 315 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 S100ZQ8WXG8 99 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CCDC115Q96NT0 180 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ANKRA2Q9H9E1 313 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 FAM20BO75063 409 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 KCNK2O95069 426 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 B2MP61769 119 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 C17orf64Q86WR6 236 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 UBASH3BQ8TF42 649 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TP53INP1Q96A56 240 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 OTUB2Q96DC9 234 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 KCNS3Q9BQ31 491 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 DSN1Q9H410 356 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ENPP5Q9UJA9 477 aa9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SLC1A7O00341 560 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 QSOX1O00391 747 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RETP07949 1114 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CD36P16671 472 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 GZMMP51124 257 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PDGFRLQ15198 375 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CTF1Q16619 201 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ZFP69Q49AA0 526 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 DENND4CQ5VZ89 1909 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CALHM3Q86XJ0 350 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 AMER3Q8N944 861 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 OR9Q2Q8NGE9 314 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 OMA1Q96E52 524 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 CEP19Q96LK0 163 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 C17orf62Q9BQA9 187 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RLIMQ9NVW2 624 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF221Q9UK13 617 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 A0A1W2PRB8 838 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 H0YIV9 168 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RGS13O14921 159 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 UGT2B11O75310 529 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ICAM2P13598 275 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 GSTM2P28161 218 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 ST13P50502 369 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 MAPK12P53778 367 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 COL19A1Q14993 1142 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 FAM9CQ8IZT9 166 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TRPC4Q9UBN4 977 aa9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
FOXN4-201ENST00000299162 POLHQ9Y253 713 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms