RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 UTS2RQ9UKP6 389 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 IFT52Q9Y366 437 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TLL1O43897 1013 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 OLFM2O95897 454 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 APODP05090 189 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PIPP12273 146 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ITGB7P26010 798 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 IMPA1P29218 277 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RGS6P49758 472 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC16A1P53985 500 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SKP1P63208 163 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 KCNJ10P78508 379 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ABATP80404 500 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SPHARQ15513 63 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NKG7Q16617 165 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 LIPIQ6XZB0 460 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 OR2A12Q8NGT7 310 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ALG14Q96F25 216 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CREBZFQ9NS37 354 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SATB2Q9UPW6 733 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FUCA1P04066 466 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NDUFS1P28331 727 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PHC1P78364 1004 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DSG2Q14126 1118 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PDGFRLQ15198 375 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 VRK3Q8IV63 474 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 OSTF1Q92882 214 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 LIPT1Q9Y234 373 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8.45□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 A0A0G2JPF8 293 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC5A10A0PJK1 596 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 METTL15A6NJ78 407 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CD160O95971 181 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 IFNGP01579 166 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RHOP08100 348 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 FURINP09958 794 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CTGFP29279 349 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 MLIPQ5VWP3 458 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PDZD3Q86UT5 571 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 OR2L2Q8NH16 312 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ZNF480Q8WV37 535 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TMEM19Q96HH6 336 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 C12orf66Q96MD2 445 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TSC2P49815 1807 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 HLA-DPB1P04440 258 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 EPHX1P07099 455 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CNR2P34972 360 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PPP3R1P63098 170 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CDC20Q12834 499 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PTOV1Q86YD1 416 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 B3GNT7Q8NFL0 401 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SFXN5Q8TD22 340 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ZNF354BQ96LW1 612 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SLC22A12Q96S37 553 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 PSD2Q9BQI7 771 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 A0A075B6Q4 140 aa8.44□□□□□ -1.06
HERC3-201ENST00000264345 AGAP14A8MT82 685 aa8.44□□□□□ -1.06
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