RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNJ10P78508 379 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TTC23Q5W5X9 447 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC80Q76M96 950 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SZRD1Q7Z422 152 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 C6orf120Q7Z4R8 191 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC37A2Q8TED4 501 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 RUBCNLQ9H714 662 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 REEP1Q9H902 201 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR27Q9NS67 375 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 VNN3Q9NY84 501 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SNX11Q9Y5W9 270 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A1W2PR48 441 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM221BA6H8Z2 402 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 C5orf58C9J3I9 102 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 TNFSF14O43557 240 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 ITGA1P56199 1179 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 RPS26P62854 115 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 BTN3A2P78410 334 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 TP53BP2Q13625 1128 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 APOFQ13790 326 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 FOXB2Q5VYV0 432 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 USP51Q70EK9 711 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 VN1R4Q7Z5H5 301 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 KCT2Q8NC54 265 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 ENTPD4Q9Y227 616 aa22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 M0QX08 132 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 RAD23AP54725 363 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 C1orf61Q13536 156 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 RFX4Q33E94 735 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 FIGLAQ6QHK4 219 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 SATL1Q86VE3 508 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 PJA1Q8NG27 643 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 NT5CQ8TCD5 201 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 AMDHD1Q96NU7 426 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 GLIPR2Q9H4G4 154 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 ZSCAN32Q9NX65 697 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKMY1Q9P2S6 941 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 PADI2Q9Y2J8 665 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A0J9YVX5 310 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A1B0GTW7 788 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM170BA6NMN3 283 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 AIFM1O95831 613 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 TFAP2AP05549 437 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 FPR1P21462 350 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 KCTD21Q4G0X4 260 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 IFI44LQ53G44 452 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 REEP3Q6NUK4 255 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 HORMAD2Q8N7B1 307 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 PSMA8Q8TAA3 256 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 TAMM41Q96BW9 452 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 C7orf34Q96L11 122 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 GRIP2Q9C0E4 1043 aa22.69■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIOO75962 3097 aa22.68■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.68■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 CRB2Q5IJ48 1285 aa22.68■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM46DQ8NEK8 389 aa22.68■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 SHDQ96IW2 340 aa22.68■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 MUS81Q96NY9 551 aa22.68■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 TWSG1Q9GZX9 223 aa22.68■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 GIMAP4Q9NUV9 329 aa22.68■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 HRASLS2Q9NWW9 162 aa22.68■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 NDUFA13Q9P0J0 144 aa22.68■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 URADA6NGE7 173 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 PGRMC2O15173 223 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 JUNDP17535 347 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 NR1H2P55055 460 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 ORAI3Q9BRQ5 295 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 FOXQ1Q9C009 403 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 YIPF3Q9GZM5 350 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 ROGDIQ9GZN7 287 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 KLHL25Q9H0H3 589 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 ING2Q9H160 280 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 SEMA3GQ9NS98 782 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM118AQ9NWS6 357 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 RAB23Q9ULC3 237 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM247A6NEH6 219 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 WASHC1A8K0Z3 465 aa22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RPUSD1-201ENST00000007264 CTSVO60911 334 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms