RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NcdnQ9Z0E0 729 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GghQ9Z0L8 317 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cytl1A1E5L0 139 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 2610001J05RikF2Z3Y9 59 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prr22F6TNE3 422 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21319F6YNI8 144 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3476K7N6V0 257 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01636 108 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AhcyP50247 432 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gabrb3P63080 473 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm1123Q1RME4 390 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dusp23Q6NT99 150 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psd2Q6P1I6 770 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dpep2Q8C255 478 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1469Q8VFW5 309 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmed10Q9D1D4 219 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sohlh2Q9D489 467 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clec2gQ9D676 269 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ItpaQ9D892 198 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cypt12Q9DAR6 119 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Amdhd1Q9DBA8 426 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clec3aQ9EPW4 196 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TicrrQ8BQ33 1889 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm8159E9Q0R1 267 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr605E9Q838 314 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm44G3UW88 330 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scarb2O35114 478 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pole2O54956 527 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp37P17141 594 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptger4P32240 513 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Matn1P51942 500 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lin52Q8CD94 116 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Unc5aQ8K1S4 898 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 McatQ8R3F5 381 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mgat2Q921V5 442 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Htra3Q9D236 459 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem35aQ9D328 167 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PgdQ9DCD0 483 aa12.3□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A0A286YDU1 74 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21876F6XK35 94 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm16427J3QN52 483 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Srp54P14576 504 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr6P34986 316 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nos3P70313 1202 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mocs1Q5RKZ7 636 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PdprQ7TSQ8 878 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Piwil2Q8CDG1 971 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itgbl1Q8VDV0 494 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtfr2Q8VED8 361 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr799Q8VGI7 311 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spred2Q924S7 410 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trpm6Q8CIR4 2028 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm14862B1AV28 81 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5478D3Z6R0 159 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ap1arE9PYF7 298 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r8L7N472 848 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hp1bp3Q3TEA8 554 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdv3Q4VAA2 281 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Thoc6Q5U4D9 341 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr871Q7TRF0 311 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dtd2Q8BHA3 168 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr692Q8VF03 329 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cbr4Q91VT4 236 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Txndc17Q9CQM5 123 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmbim6Q9D2C7 237 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9DA42 136 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B3galt5Q9JI67 308 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Omt2aF6ZJR3 104 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10479K7N6H4 105 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gcm2O09102 504 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TrhrP21761 393 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nsg2P47759 171 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BcheQ03311 603 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vwa5b2Q3UR50 1248 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc15a3Q8BPX9 578 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fem1abQ8C0T1 654 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mettl21eQ8CDZ2 244 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem185bQ8R3R5 350 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr868Q8VFI8 309 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EdaraddQ8VHX2 208 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Khdrbs2Q9WU01 349 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fem1aaQ9Z2G1 654 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm13283A0A087WPG5 182 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm13040A2A8C4 496 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tspan6O70401 245 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ComtO88587 265 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnmt3cP0DOY1 709 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rps17P63276 135 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr616Q3KPB0 317 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2-Eb2Q3UUV9 287 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf451Q8C0P7 1056 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ExogQ8C163 368 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r205Q8R276 316 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxe1Q8R2I0 371 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atoh8Q99NA2 322 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kdelr2Q9CQM2 212 aa12.29□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5145F8VQ88 278 aa12.28□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm17174M0QWQ9 212 aa12.28□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hps1O08983 704 aa12.28□□□□□ -0.44
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dok2O70469 412 aa12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.5 ms