RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm11487Q5RIS0 354 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp1r15bQ8BFW3 697 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FkrpQ8CG64 494 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sirt4Q8R216 333 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pskh1Q91YA2 424 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HadhbQ99JY0 475 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HttP42859 3119 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CtcflA2APF3 636 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CryaaP24622 196 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hoxd13P70217 339 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Otub1Q7TQI3 271 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptbp3Q8BHD7 523 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrc69Q9D9Q0 347 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Btnl6A2CG22 539 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm3149E9PW52 257 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm4775F7ANJ3 135 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8362K7N6Y6 257 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm17026K7N6Z0 213 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tk1P04184 233 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Id2P41136 134 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo40P62932 710 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rassf5Q5EBH1 413 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 F12Q80YC5 597 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GalpQ810H5 117 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sumf2Q8BPG6 308 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sh3rf2Q8BZT2 735 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp51a1Q8K0C4 503 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mapre2Q8R001 326 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4930578G10RikQ9D4Q4 153 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ankrd7Q9D504 279 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp5oQ9DB20 213 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spry1Q9QXV9 313 aa15.4■□□□□ 0.06
Ptprn-201ENSMUST00000027404 A430033K04RikE9Q8G5 680 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HbaP01942 142 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp1b2P14231 290 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ArntP53762 791 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rps13P62301 151 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 B4galnt2Q09199 510 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Xkr5Q5GH66 676 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ggt1Q60928 568 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmc6Q7TN60 810 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf516Q7TSH3 1157 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vangl1Q80Z96 526 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mgat4bQ812F8 548 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mon1bQ8BMQ8 553 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Med19Q8C1S0 244 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1276Q8VF40 312 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhac1Q91Y10 964 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trpv4Q9EPK8 871 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pkp4Q68FH0 1190 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam189a1Q6A044 515 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ugt2a2Q6PDD0 528 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Igsf5Q7TSN7 370 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phf24Q80TL4 400 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr62Q80UC6 358 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Enpp6Q8BGN3 440 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itih5Q8BJD1 952 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Galnt13Q8CF93 556 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9D112 206 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp964B2RR88 472 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tsga10ipF7A1F0 157 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r16K7N775 303 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rgs7O54829 469 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ChadO55226 358 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ntf3P20181 258 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AcadvlP50544 656 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc37a3Q3TIT8 494 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kbtbd8Q3UQV5 599 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm732Q3V0P9 516 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp184Q7TSH9 737 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nipal3Q8BGN5 410 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nlrp10Q8CCN1 673 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q8K207 121 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fmo2Q8K2I3 535 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PxnQ8VI36 591 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rps19Q9CZX8 145 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr701Q9D3U9 316 aa15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptges3Q9R0Q7 160 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FarsbQ9WUA2 589 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spin2-ps6A0A140T8V2 174 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CrnnD3YUU6 520 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mybpc3O70468 1270 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01665 111 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 P01666 111 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acsl1P41216 699 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrtgQ2EY15 1191 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm136Q3V037 328 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Taar7eQ5QD09 358 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cfap20Q8BTU1 193 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Steap2Q8BWB6 489 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dleu7Q8CHZ8 209 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr382Q8VF79 312 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Unc13cQ8K0T7 2210 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr742A2RTP5 311 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r95L7N274 845 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptpn6P29351 595 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Syt4P40749 425 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 QrfprP83861 433 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CrtamQ149L7 389 aa15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.5 ms