RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635997.1

NEDD4L-238, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5 BASIC

Gene NEDD4L, Length 4,402 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-238	ENST00000635997	CAMK1	Q14012	370 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCNI	Q14094	377 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	ELOA3	Q8NG57	546 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	RDH14	Q9HBH5	336 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	SSR3	Q9UNL2	185 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	LAMB2	P55268	1798 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997		G3V2L1	256 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	ENTPD1	P49961	510 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	ITGA1	P56199	1179 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	ENPP2	Q13822	863 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	SYT16	Q17RD7	645 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	GTDC1	Q4AE62	458 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	KDM1B	Q8NB78	822 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	NRG4	Q8WWG1	115 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	NODAL	Q96S42	347 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	MUC13	Q9H3R2	512 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997		Q9N2J8	555 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	AQP12B	A6NM10	295 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR2B3	O76000	313 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	HOXC13	P31276	330 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	P2RY2	P41231	377 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	RHAG	Q02094	409 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	MANEA	Q5SRI9	462 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	OGFOD2	Q6N063	350 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	ASPG	Q86U10	573 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	PHF11	Q9UIL8	331 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	PCTP	Q9UKL6	214 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	ASNA1	O43681	348 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	COQ9	O75208	318 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	FH	P07954	510 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR12D1	P0DN82	309 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	CD27	P26842	260 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	HERC3	Q15034	1050 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	NEK5	Q6P3R8	708 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	ENKUR	Q8TC29	256 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	PVR	P15151	417 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	MATN1	P21941	496 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	ITGA3	P26006	1051 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21	4e-10	■■■□□ 16.7
NEDD4L-238	ENST00000635997	TTK	P33981	857 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	SGCB	Q16585	318 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	LIPJ	Q5W064	366 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR2T29	Q8NH02	315 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	APIP	Q96GX9	242 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	LHX3	Q9UBR4	397 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NEDD4L-238	ENST00000635997	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	WASH4P	A8MWX3	477 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	APOO	Q9BUR5	198 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	CENPX	A8MT69	81 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	OTX2	P32243	289 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	NRG3	P56975	720 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	XIAP	P98170	497 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	RHD	Q02161	417 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR7G3	Q8NG95	312 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	MYRFL	Q96LU7	910 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	TLR4	O00206	839 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRAPPC6A	O75865	159 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	INMT	O95050	263 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	DAG1	Q14118	895 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NEDD4L-238	ENST00000635997	GATA6	Q92908	595 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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