RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 LYRM4Q9HD34 91 aa8.04□□□□□ -1.12
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SGMS1-211ENST00000626236 SLC22A11Q9NSA0 550 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-211ENST00000626236 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-211ENST00000626236 CTSFQ9UBX1 484 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-211ENST00000626236 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa8.04□□□□□ -1.12
SGMS1-211ENST00000626236 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
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SGMS1-211ENST00000626236 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.04□□□□□ -1.12
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SGMS1-211ENST00000626236 SNX3O60493 162 aa8.03□□□□□ -1.12
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SGMS1-211ENST00000626236 GUCY1B2O75343 617 aa8.03□□□□□ -1.12
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SGMS1-211ENST00000626236 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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SGMS1-211ENST00000626236 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-211ENST00000626236 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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SGMS1-211ENST00000626236 OVCH1Q7RTY7 1134 aa8.03□□□□□ -1.12
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SGMS1-211ENST00000626236 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa8.03□□□□□ -1.12
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SGMS1-211ENST00000626236 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
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SGMS1-211ENST00000626236 AIG1Q9NVV5 245 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-211ENST00000626236 MS4A12Q9NXJ0 267 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-211ENST00000626236 ASIC5Q9NY37 505 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-211ENST00000626236 KCMF1Q9P0J7 381 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.03□□□□□ -1.12
SGMS1-211ENST00000626236 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.03□□□□□ -1.12
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SGMS1-211ENST00000626236 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.02□□□□□ -1.13
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SGMS1-211ENST00000626236 DLSTP36957 453 aa8.02□□□□□ -1.13
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SGMS1-211ENST00000626236 STAT5AP42229 794 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 ASMTP46597 345 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
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SGMS1-211ENST00000626236 STX1BP61266 288 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 CBX1P83916 185 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 MC1RQ01726 317 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 KLC1Q07866 573 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 C2orf80Q0P641 193 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 HEPACAMQ14CZ8 416 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 NCF4Q15080 339 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 RPS6KA2Q15349 733 aa8.02□□□□□ -1.13
SGMS1-211ENST00000626236 NKG7Q16617 165 aa8.02□□□□□ -1.13
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